Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000141 CC 24 20 19 24 87 CG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.103 000161 -- 0 1 0 0 1 +- 1 7 2 3 13 ++ 26 13 20 21 80 0.010 0.002 0.050 0.107 0.318 000166 -- 26 19 21 24 90 +- 1 2 1 0 4 ++ 0 0 0 0 0 0.010 0.053 0.012 0.000 0.044 000222 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 1 1 6 GG 23 21 21 23 88 0.173 0.000 0.012 0.011 0.102 000443 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 14 19 21 78 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 000736 AA 26 21 22 22 91 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 000798 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 21 22 21 91 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 000811 -- 7 13 12 2 34 +- 14 7 9 16 46 ++ 6 1 1 6 14 0.040 0.002 0.182 3.311 0.059 000896 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 3 0 6 GG 23 22 19 24 88 0.097 0.000 0.118 0.000 0.102 001006 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 22 22 20 23 87 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 001049 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 24 22 20 22 88 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 001055 AA 1 1 0 3 5 AC 7 7 7 17 38 CC 15 14 13 3 45 0.025 0.011 0.900 5.261 0.690 001073 CC 22 22 19 23 86 CG 1 0 1 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.013 0.000 0.012 001079 CC 15 14 13 4 46 CG 6 7 7 16 36 GG 1 1 0 3 5 0.153 0.011 0.900 3.569 0.355 001094 -- 0 0 0 0 0 +- 3 0 3 0 6 ++ 23 22 19 23 87 0.097 0.000 0.118 0.000 0.103 001367 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 26 21 22 24 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 001599 CC 0 0 0 0 0 CT 3 0 3 0 6 TT 23 21 19 24 87 0.097 0.000 0.118 0.000 0.103 001606 GG 0 0 0 0 0 GT 3 0 3 0 6 TT 23 21 19 24 87 0.097 0.000 0.118 0.000 0.103 001658 CC 0 0 0 0 0 CG 0 2 0 0 2 GG 26 19 22 24 91 0.000 0.053 0.000 0.000 0.011 001964 CC 24 22 19 24 89 CG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 001972 CC 0 0 0 0 0 CG 3 0 3 0 6 GG 24 22 19 24 89 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 002037 CC 27 22 22 22 93 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 002232 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 3 0 5 GG 24 22 19 22 87 0.042 0.000 0.118 0.000 0.072 002551 GG 1 0 0 0 1 GT 6 0 3 0 9 TT 19 20 18 23 80 0.336 0.000 0.124 0.000 1.488 002578 AA 0 0 0 0 0 AC 3 0 1 2 6 CC 23 20 20 21 84 0.097 0.000 0.012 0.048 0.107 002808 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 002955 AA 23 22 19 23 87 AG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.118 0.000 0.103 003493 AA 15 13 15 2 45 AG 9 7 7 17 40 GG 3 1 0 3 7 0.773 0.002 0.787 6.622 0.216 003933 AA 23 21 21 22 87 AG 3 0 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.000 0.026 004031 CC 27 14 21 22 84 CT 0 0 0 2 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.012 004202 AA 24 14 19 24 81 AG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.111 005030 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 1 1 3 ++ 25 22 21 23 91 0.010 0.000 0.012 0.011 0.025 005209 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 005605 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 1 1 3 CC 25 21 19 23 88 0.010 0.000 0.013 0.011 0.026 005756 CC 0 0 0 0 0 CT 4 0 0 0 4 TT 22 21 21 24 88 0.181 0.000 0.000 0.000 0.045 005945 GG 22 22 22 24 90 GT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.181 0.000 0.000 0.000 0.044 006081 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 0 1 1 ++ 26 22 22 23 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 006122 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 26 22 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 006220 CC 23 21 19 23 86 CT 3 0 3 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.118 0.000 0.105 006357 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 006436 CC 26 22 22 23 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 006658 AA 0 0 0 0 0 AT 0 0 1 0 1 TT 27 22 21 23 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 006891 CC 24 22 19 23 88 CT 3 0 3 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.102 006971 -- 0 0 0 0 0 +- 3 0 0 0 3 ++ 24 22 22 23 91 0.093 0.000 0.000 0.000 0.025 007166 CC 0 0 0 0 0 CT 3 0 3 0 6 TT 24 22 19 24 89 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 007279 AA 24 22 22 24 92 AT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 007438 AA 24 22 19 24 89 AG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 007439 CC 7 14 12 2 35 CT 14 7 9 16 46 TT 6 1 1 6 14 0.040 0.011 0.182 3.311 0.031 007668 GG 23 22 20 23 88 GT 4 0 1 1 6 TT 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.012 0.011 0.102 007693 GG 27 22 22 22 93 GT 0 0 0 2 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 007727 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 1 0 1 ++ 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 008523 CC 26 20 19 20 85 CG 1 0 0 1 2 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.012 0.012 008570 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 27 21 21 22 91 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 008580 GG 27 22 21 22 92 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 008924 GG 26 22 22 24 94 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 009022 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 2 3 GG 27 22 21 21 91 0.000 0.000 0.012 0.048 0.025 009106 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 009566 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 26 21 22 22 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 009613 CC 27 21 22 22 92 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 009705 AA 24 22 19 24 89 AG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 009897 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 010079 AA 0 0 0 0 0 AG 0 3 0 0 3 GG 27 19 22 24 92 0.000 0.118 0.000 0.000 0.024 010579 CC 27 21 22 24 94 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 010635 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 1 1 3 ++ 26 22 21 23 92 0.010 0.000 0.012 0.011 0.024 010647 CC 11 1 1 6 19 CT 10 7 9 16 42 TT 6 14 12 2 34 1.465 0.011 0.182 3.311 0.825 010708 CC 21 3 7 23 54 CT 5 8 11 0 24 TT 0 11 3 0 14 0.294 0.577 0.159 0.000 11.702 010798 AA 24 22 19 24 89 AG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 012364 AA 26 22 22 24 94 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 012607 AA 24 22 19 24 89 AG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 012703 CC 24 22 19 24 89 CG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 012867 GG 26 22 22 24 94 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 012903 AA 24 22 19 24 89 AG 3 0 3 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 012945 -- 0 0 0 0 0 +- 2 0 0 0 2 ++ 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 013003 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 013080 AA 24 22 19 24 89 AT 3 0 3 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 013523 AA 25 21 22 23 91 AC 0 0 0 1 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 013551 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 21 21 24 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 013608 CC 7 14 13 2 36 CT 11 6 8 17 42 TT 6 1 1 5 13 0.160 0.114 0.027 4.629 0.018 013648 CC 22 21 22 24 89 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 013763 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 22 20 22 20 84 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 013767 CC 21 21 21 19 82 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 013849 -- 16 1 1 12 30 +- 7 7 9 12 35 ++ 0 14 12 0 26 0.741 0.011 0.182 2.667 4.784 014205 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 3 0 6 GG 19 21 18 23 81 0.118 0.000 0.124 0.000 0.111 014339 -- 21 20 21 22 84 +- 2 0 0 0 2 ++ 0 0 0 0 0 0.048 0.000 0.000 0.000 0.012 015011 CC 27 21 22 24 94 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 015037 GG 26 22 22 24 94 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 015068 AA 24 22 19 24 89 AT 3 0 3 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.118 0.000 0.101 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000161: AGTACTACAAGCAAGGAATCAAATAGTATGTCTCTCATGTGAACATTT 000166: TAC 000811: GGTGTCTTGCCCACAGCTTGGGGAGCGGCCCCGGGCGC 001094: CC 005030: aaaat 006081: ttaa 006971: tt 007727: ca 010635: ttat 012945: tttct 013849: T 014339: T