Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000192 - 0.23 + 0.77 0.36 000220 A 0.01 G 0.99 0.01 000248 A 0.01 G 0.99 0.02 000276 G 0.10 A 0.90 0.19 000301 + 0.03 - 0.97 0.06 000356 A 0.20 C 0.80 0.32 000427 A 0.01 G 0.99 0.01 000519 T 0.01 C 0.99 0.02 001049 C 0.07 T 0.93 0.13 001088 T 0.01 G 0.99 0.01 001244 + 0.01 - 0.99 0.01 001246 T 0.21 C 0.79 0.33 001529 + 0.35 - 0.65 0.46 001585 - 0.07 + 0.93 0.14 001610 T 0.03 A 0.97 0.06 001669 G 0.02 A 0.98 0.04 001678 C 0.01 T 0.99 0.01 001864 T 0.29 A 0.71 0.41 001942 - 0.02 + 0.98 0.04 001987 A 0.01 G 0.99 0.01 002060 T 0.01 C 0.99 0.01 002199 T 0.03 C 0.97 0.05 002239 - 0.33 + 0.67 0.44 002332 G 0.01 T 0.99 0.02 002609 A 0.20 C 0.80 0.33 002672 G 0.20 C 0.80 0.33 002677 C 0.01 A 0.99 0.01 002760 T 0.39 C 0.61 0.48 003129 A 0.01 G 0.99 0.01 003165 A 0.01 T 0.99 0.02 003229 G 0.01 A 0.99 0.01 003300 - 0.01 + 0.99 0.01 003617 T 0.01 G 0.99 0.02 003650 G 0.35 C 0.65 0.46 003717 T 0.03 G 0.97 0.07 003743 A 0.01 G 0.99 0.01 003918 T 0.31 C 0.69 0.43 003938 A 0.01 C 0.99 0.01 003945 A 0.30 G 0.70 0.42 003950 T 0.30 A 0.70 0.42 003968 + 0.22 - 0.78 0.34 004017 G 0.08 T 0.92 0.15 004077 T 0.01 C 0.99 0.01 004218 A 0.02 G 0.98 0.05 004261 T 0.36 C 0.64 0.46 004309 C 0.30 T 0.70 0.42 004365 T 0.33 C 0.67 0.44 004366 A 0.01 G 0.99 0.01 004394 T 0.01 G 0.99 0.01 004400 T 0.01 C 0.99 0.01 004430 A 0.01 G 0.99 0.01 004463 T 0.35 C 0.65 0.46 004478 T 0.01 G 0.99 0.01 004599 T 0.20 A 0.80 0.33 004683 G 0.30 A 0.70 0.42 004933 A 0.43 G 0.57 0.49 004981 T 0.22 C 0.78 0.34 005015 G 0.33 A 0.67 0.44 005044 A 0.01 G 0.99 0.01 005047 A 0.08 G 0.92 0.15 005061 C 0.35 T 0.65 0.45 005069 - 0.01 + 0.99 0.02 005214 A 0.01 G 0.99 0.01 005380 T 0.01 C 0.99 0.01 005420 G 0.01 C 0.99 0.02 005503 T 0.01 C 0.99 0.01 005551 T 0.01 G 0.99 0.02 005772 T 0.36 C 0.64 0.46 005872 A 0.21 G 0.79 0.33 006161 A 0.07 G 0.93 0.13 006190 C 0.01 T 0.99 0.01 006402 C 0.20 G 0.80 0.32 006524 A 0.20 G 0.80 0.32 006625 T 0.01 C 0.99 0.01 012753 C 0.02 A 0.98 0.04 012984 A 0.19 C 0.81 0.31 013112 A 0.07 G 0.93 0.12 013366 G 0.10 C 0.90 0.19 013526 C 0.30 T 0.70 0.42 013610 G 0.37 T 0.63 0.46 013625 C 0.22 T 0.78 0.35 013672 C 0.07 G 0.93 0.13 013730 G 0.01 T 0.99 0.02 013800 A 0.01 G 0.99 0.01 013813 A 0.01 G 0.99 0.01 013881 A 0.03 G 0.97 0.06 013911 T 0.07 C 0.93 0.13 014034 T 0.21 C 0.79 0.33 014197 T 0.17 C 0.83 0.28 016716 T 0.01 C 0.99 0.02 016924 A 0.01 C 0.99 0.01 017051 G 0.24 A 0.76 0.36 017055 T 0.23 C 0.77 0.35 017373 C 0.05 T 0.95 0.10 017545 T 0.01 C 0.99 0.01 017895 A 0.01 C 0.99 0.01 018006 T 0.01 C 0.99 0.01 018030 A 0.40 G 0.60 0.48 018224 A 0.22 G 0.78 0.34 018343 A 0.01 G 0.99 0.01 018498 T 0.34 C 0.66 0.45 018716 T 0.01 C 0.99 0.01 018720 C 0.01 A 0.99 0.01 018755 A 0.01 C 0.99 0.01 018770 T 0.01 C 0.99 0.01 018970 + 0.01 - 0.99 0.01 019064 T 0.39 C 0.61 0.47 019065 A 0.01 G 0.99 0.01 019161 T 0.01 C 0.99 0.01 019166 T 0.31 C 0.69 0.43 019169 A 0.01 G 0.99 0.02 019240 G 0.46 A 0.54 0.50 019556 G 0.02 C 0.98 0.03 019560 T 0.42 G 0.58 0.49 019906 A 0.31 G 0.69 0.43 019914 C 0.33 A 0.67 0.44 020184 + 0.01 - 0.99 0.01 020289 T 0.01 C 0.99 0.01 020389 T 0.22 C 0.78 0.34 020665 C 0.04 G 0.96 0.08 021158 T 0.01 C 0.99 0.01 021358 G 0.01 A 0.99 0.01 021360 C 0.02 G 0.98 0.04 021449 G 0.26 A 0.74 0.39 021521 T 0.01 C 0.99 0.01 021538 C 0.01 G 0.99 0.01 021588 G 0.08 C 0.92 0.15 021853 A 0.01 G 0.99 0.01 021879 T 0.38 C 0.62 0.47 021913 A 0.01 G 0.99 0.01 021916 C 0.01 T 0.99 0.01 021920 A 0.19 C 0.81 0.31 022280 A 0.01 G 0.99 0.01 022324 C 0.16 T 0.84 0.28 022332 T 0.16 C 0.84 0.28 022427 A 0.01 G 0.99 0.01 022733 A 0.01 G 0.99 0.03 023023 - 0.29 + 0.71 0.41 023468 A 0.01 G 0.99 0.01 023556 A 0.01 G 0.99 0.02 024005 A 0.01 G 0.99 0.01 024146 T 0.30 A 0.70 0.42 025518 A 0.01 G 0.99 0.01 025537 C 0.35 T 0.65 0.45 025626 A 0.02 G 0.98 0.04 025691 A 0.33 G 0.67 0.44 025693 A 0.03 G 0.97 0.05 025717 T 0.01 C 0.99 0.01 025734 G 0.01 A 0.99 0.02 025810 C 0.03 G 0.97 0.05 025895 A 0.01 G 0.99 0.01 026127 G 0.01 C 0.99 0.01 026228 T 0.13 G 0.87 0.22 026298 G 0.33 A 0.67 0.44 026324 C 0.11 T 0.89 0.19 026608 C 0.35 T 0.65 0.45 026789 - 0.18 + 0.82 0.29 026878 T 0.02 C 0.98 0.04 027237 G 0.42 A 0.58 0.49 027273 C 0.31 G 0.69 0.43 027675 T 0.34 G 0.66 0.45 027738 C 0.02 A 0.98 0.03 027775 T 0.17 C 0.83 0.28 027779 - 0.10 + 0.90 0.19 027782 G 0.01 T 0.99 0.03 027807 G 0.01 C 0.99 0.01 027862 T 0.02 C 0.98 0.04 028142 A 0.02 G 0.98 0.03 028234 G 0.02 A 0.98 0.03 029221 T 0.01 G 0.99 0.01 029394 G 0.01 A 0.99 0.02 030145 G 0.39 A 0.61 0.48 030369 A 0.22 C 0.78 0.34 030852 T 0.01 C 0.99 0.01 030933 C 0.01 G 0.99 0.01 031394 A 0.33 G 0.67 0.44 031449 T 0.01 C 0.99 0.01 031463 A 0.01 G 0.99 0.02 031510 T 0.21 C 0.79 0.33 031522 A 0.02 G 0.98 0.04 031740 T 0.01 C 0.99 0.02 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000192: c 000301: a 001244: gtcc 001529: CCTCTA 001585: GGACCTGGAGTCTCCTCCTTGGGGA 001942: ctttttt 002239: CTATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGG 003300: ct 003968: GCCACCT 005069: C 018970: tg 020184: ccc 023023: gccc 026789: GGCGGCAACTGCGGT 027779: G