Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000361 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 000370 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000396 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 000401 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000518 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 000521 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000599 - 0.02 0.02 0.25 0.02 0.08 + 0.98 0.98 0.75 0.98 0.92 0.04 0.05 0.38 0.04 0.14 000661 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000669 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000681 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000700 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000702 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000745 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000971 - 0.06 0.02 0.25 0.02 0.09 + 0.94 0.98 0.75 0.98 0.91 0.10 0.05 0.38 0.04 0.16 001064 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001120 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001356 C 0.06 0.14 0.23 0.21 0.16 T 0.94 0.86 0.77 0.79 0.84 0.11 0.24 0.35 0.33 0.26 001389 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 001445 A 0.00 0.00 0.02 0.02 0.01 G 1.00 1.00 0.98 0.98 0.99 0.00 0.00 0.04 0.04 0.02 001473 G 0.06 0.14 0.23 0.21 0.16 A 0.94 0.86 0.77 0.79 0.84 0.11 0.24 0.35 0.33 0.26 001914 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 001960 T 0.20 0.05 0.05 0.00 0.08 C 0.80 0.95 0.95 1.00 0.92 0.32 0.09 0.09 0.00 0.15 002062 C 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 T 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 002157 A 0.06 0.02 0.25 0.02 0.08 G 0.94 0.98 0.75 0.98 0.92 0.10 0.04 0.38 0.04 0.15 002187 A 0.00 0.07 0.02 0.00 0.02 G 1.00 0.93 0.98 1.00 0.98 0.00 0.13 0.04 0.00 0.04 002218 T 0.13 0.09 0.02 0.00 0.06 G 0.87 0.91 0.98 1.00 0.94 0.23 0.17 0.04 0.00 0.12 002373 G 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 A 1.00 0.91 1.00 1.00 0.98 0.00 0.17 0.00 0.00 0.04 002431 A 0.02 0.02 0.25 0.02 0.07 G 0.98 0.98 0.75 0.98 0.93 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 002727 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 002794 A 0.04 0.14 0.23 0.21 0.15 G 0.96 0.86 0.77 0.79 0.85 0.07 0.24 0.35 0.33 0.25 002865 C 0.00 0.00 0.02 0.06 0.02 G 1.00 1.00 0.98 0.94 0.98 0.00 0.00 0.04 0.12 0.04 002915 C 0.06 0.02 0.25 0.02 0.09 T 0.94 0.98 0.75 0.98 0.91 0.10 0.04 0.38 0.04 0.16 002928 G 0.02 0.02 0.25 0.02 0.08 T 0.98 0.98 0.75 0.98 0.92 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 003087 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 003137 A 0.07 0.43 0.27 0.50 0.31 G 0.93 0.57 0.73 0.50 0.69 0.14 0.49 0.40 0.50 0.43 003157 T 0.26 0.09 0.02 0.06 0.12 A 0.74 0.91 0.98 0.94 0.88 0.38 0.17 0.04 0.12 0.20 003208 G 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 003254 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 003335 T 0.00 0.02 0.09 0.00 0.03 G 1.00 0.98 0.91 1.00 0.97 0.00 0.04 0.17 0.00 0.05 003379 A 0.06 0.14 0.23 0.21 0.15 G 0.94 0.86 0.77 0.79 0.85 0.10 0.24 0.35 0.33 0.26 003393 G 0.02 0.05 0.02 0.00 0.02 A 0.98 0.95 0.98 1.00 0.98 0.04 0.09 0.04 0.00 0.04 003920 T 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 C 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 003938 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004312 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004415 - 0.22 0.70 0.40 0.67 0.49 + 0.78 0.30 0.60 0.33 0.51 0.35 0.42 0.48 0.44 0.50 004598 G 0.12 0.16 0.48 0.22 0.24 A 0.88 0.84 0.52 0.78 0.76 0.20 0.27 0.50 0.34 0.36 004613 C 0.02 0.02 0.25 0.02 0.08 T 0.98 0.98 0.75 0.98 0.92 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 004634 C 0.12 0.18 0.48 0.22 0.24 T 0.88 0.82 0.52 0.78 0.76 0.20 0.30 0.50 0.34 0.37 004778 G 0.06 0.14 0.23 0.21 0.15 A 0.94 0.86 0.77 0.79 0.85 0.11 0.24 0.35 0.33 0.26 004978 G 0.08 0.43 0.27 0.50 0.31 C 0.92 0.57 0.73 0.50 0.69 0.14 0.49 0.40 0.50 0.43 005022 G 0.08 0.16 0.48 0.23 0.23 T 0.92 0.84 0.52 0.77 0.77 0.14 0.27 0.50 0.35 0.35 005055 T 0.00 0.00 0.05 0.06 0.03 G 1.00 1.00 0.95 0.94 0.97 0.00 0.00 0.09 0.12 0.05 005146 + 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 005178 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005410 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 005532 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 005987 G 0.07 0.16 0.48 0.23 0.23 C 0.93 0.84 0.52 0.77 0.77 0.14 0.27 0.50 0.35 0.35 006043 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 006070 T 0.06 0.14 0.23 0.21 0.15 C 0.94 0.86 0.77 0.79 0.85 0.10 0.24 0.35 0.33 0.26 006080 A 0.22 0.70 0.39 0.65 0.48 G 0.78 0.30 0.61 0.35 0.52 0.35 0.42 0.47 0.46 0.50 006086 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 006241 T 0.26 0.09 0.02 0.06 0.12 C 0.74 0.91 0.98 0.94 0.88 0.38 0.17 0.04 0.12 0.20 006367 T 0.02 0.02 0.25 0.02 0.07 C 0.98 0.98 0.75 0.98 0.93 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 006574 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006619 G 0.37 0.25 0.50 0.29 0.35 A 0.63 0.75 0.50 0.71 0.65 0.47 0.38 0.50 0.41 0.46 006633 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 006873 G 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.05 0.00 0.07 007044 G 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 007130 A 0.02 0.14 0.23 0.21 0.14 G 0.98 0.86 0.77 0.79 0.86 0.04 0.24 0.35 0.33 0.24 007224 G 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 007338 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 007501 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 007649 G 0.17 0.16 0.50 0.23 0.26 T 0.83 0.84 0.50 0.77 0.74 0.28 0.27 0.50 0.35 0.38 007775 T 0.41 0.02 0.07 0.00 0.14 C 0.59 0.98 0.93 1.00 0.86 0.48 0.04 0.13 0.00 0.24 008177 - 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 008182 C 0.02 0.02 0.25 0.02 0.07 T 0.98 0.98 0.75 0.98 0.93 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 008194 - 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 008217 T 0.06 0.14 0.23 0.21 0.15 C 0.94 0.86 0.77 0.79 0.85 0.10 0.24 0.35 0.33 0.26 008259 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 009970 A 0.37 0.25 0.45 0.30 0.34 T 0.63 0.75 0.55 0.70 0.66 0.47 0.38 0.50 0.42 0.45 010179 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 010187 G 0.07 0.16 0.45 0.23 0.22 C 0.93 0.84 0.55 0.77 0.78 0.14 0.27 0.50 0.35 0.34 010210 G 0.07 0.16 0.45 0.23 0.22 A 0.93 0.84 0.55 0.77 0.78 0.14 0.27 0.50 0.35 0.34 010283 G 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 010308 T 0.02 0.00 0.03 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.97 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 010318 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 010356 A 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 010521 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 010676 A 0.08 0.16 0.48 0.23 0.23 G 0.92 0.84 0.52 0.77 0.77 0.14 0.27 0.50 0.35 0.35 010756 G 0.02 0.02 0.25 0.02 0.07 A 0.98 0.98 0.75 0.98 0.93 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 011013 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 011234 + 0.07 0.16 0.48 0.22 0.22 - 0.93 0.84 0.52 0.78 0.78 0.14 0.27 0.50 0.34 0.35 011315 T 0.00 0.00 0.25 0.07 0.06 C 1.00 1.00 0.75 0.93 0.94 0.00 0.00 0.38 0.12 0.12 011684 C 0.08 0.14 0.48 0.23 0.23 T 0.92 0.86 0.52 0.77 0.77 0.15 0.24 0.50 0.35 0.35 011729 A 0.00 0.00 0.05 0.05 0.02 G 1.00 1.00 0.95 0.95 0.98 0.00 0.00 0.09 0.09 0.04 011909 G 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 011916 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 011917 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 012214 T 0.21 0.05 0.05 0.00 0.08 C 0.79 0.95 0.95 1.00 0.92 0.33 0.09 0.09 0.00 0.15 012338 C 0.02 0.02 0.25 0.02 0.07 T 0.98 0.98 0.75 0.98 0.93 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 012431 - 0.04 0.05 0.05 0.00 0.03 + 0.96 0.95 0.95 1.00 0.97 0.07 0.09 0.09 0.00 0.06 012472 A 0.11 0.16 0.47 0.23 0.23 C 0.89 0.84 0.53 0.77 0.77 0.20 0.27 0.50 0.35 0.36 012601 A 0.04 0.14 0.25 0.21 0.15 T 0.96 0.86 0.75 0.79 0.85 0.07 0.24 0.38 0.33 0.26 012785 - 0.03 0.02 0.25 0.02 0.08 + 0.97 0.98 0.75 0.98 0.92 0.06 0.04 0.38 0.04 0.15 012933 T 0.25 0.09 0.02 0.06 0.11 C 0.75 0.91 0.98 0.94 0.89 0.38 0.17 0.04 0.12 0.20 013151 A 0.02 0.02 0.25 0.02 0.07 G 0.98 0.98 0.75 0.98 0.93 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 013254 A 0.04 0.02 0.23 0.02 0.07 G 0.96 0.98 0.78 0.98 0.93 0.08 0.05 0.35 0.04 0.13 013503 T 0.12 0.00 0.03 0.00 0.04 G 0.88 1.00 0.97 1.00 0.96 0.21 0.00 0.05 0.00 0.07 013575 G 0.00 0.00 0.03 0.02 0.01 A 1.00 1.00 0.97 0.98 0.99 0.00 0.00 0.05 0.04 0.02 013580 A 0.04 0.10 0.03 0.00 0.04 C 0.96 0.90 0.97 1.00 0.96 0.07 0.17 0.05 0.00 0.07 013748 C 0.10 0.15 0.44 0.30 0.24 T 0.90 0.85 0.56 0.70 0.76 0.19 0.26 0.49 0.42 0.36 013760 G 0.06 0.45 0.33 0.50 0.33 A 0.94 0.55 0.67 0.50 0.67 0.12 0.50 0.44 0.50 0.44 013961 - 0.12 0.20 0.14 0.14 0.15 + 0.88 0.80 0.86 0.86 0.85 0.22 0.32 0.24 0.24 0.25 014037 G 0.12 0.00 0.00 0.00 0.04 A 0.88 1.00 1.00 1.00 0.96 0.21 0.00 0.00 0.00 0.07 014063 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 014085 T 0.06 0.12 0.19 0.18 0.14 C 0.94 0.88 0.81 0.82 0.86 0.11 0.22 0.31 0.30 0.23 022475 A 0.02 0.02 0.25 0.02 0.07 G 0.98 0.98 0.75 0.98 0.93 0.04 0.04 0.38 0.04 0.14 022643 T 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 023010 A 0.25 0.09 0.02 0.06 0.11 T 0.75 0.91 0.98 0.94 0.89 0.38 0.17 0.05 0.12 0.20 023091 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 023121 T 0.25 0.09 0.02 0.06 0.11 A 0.75 0.91 0.98 0.94 0.89 0.38 0.17 0.05 0.12 0.20 023152 A 0.04 0.14 0.21 0.21 0.15 G 0.96 0.86 0.79 0.79 0.85 0.07 0.24 0.34 0.33 0.25 023481 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 029548 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 029555 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 029625 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 029789 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 029851 T 0.00 0.16 0.02 0.06 0.06 C 1.00 0.84 0.98 0.94 0.94 0.00 0.27 0.05 0.12 0.11 029861 G 0.00 0.00 0.05 0.06 0.03 A 1.00 1.00 0.95 0.94 0.97 0.00 0.00 0.09 0.12 0.05 029988 A 0.02 0.02 0.21 0.02 0.06 G 0.98 0.98 0.79 0.98 0.94 0.04 0.05 0.34 0.04 0.12 030230 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 030265 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 030608 C 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 030973 G 0.07 0.00 0.02 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.98 1.00 0.97 0.14 0.00 0.04 0.00 0.05 031160 A 0.04 0.14 0.23 0.21 0.15 G 0.96 0.86 0.77 0.79 0.85 0.07 0.24 0.35 0.33 0.25 037506 A 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 037577 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 037986 A 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 G 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 038145 C 0.13 0.27 0.11 0.15 0.16 G 0.87 0.73 0.89 0.85 0.84 0.23 0.40 0.20 0.25 0.27 038214 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 038743 + 0.12 0.00 0.07 0.06 0.06 - 0.88 1.00 0.93 0.94 0.94 0.20 0.00 0.13 0.12 0.12 039045 G 0.16 0.00 0.02 0.00 0.05 T 0.84 1.00 0.98 1.00 0.95 0.27 0.00 0.04 0.00 0.09 039128 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 039174 T 0.14 0.00 0.02 0.00 0.04 C 0.86 1.00 0.98 1.00 0.96 0.24 0.00 0.04 0.00 0.08 039176 A 0.14 0.28 0.11 0.15 0.16 G 0.86 0.72 0.89 0.85 0.84 0.24 0.40 0.20 0.25 0.28 039312 G 0.38 0.47 0.57 0.52 0.48 C 0.62 0.53 0.43 0.48 0.52 0.47 0.50 0.49 0.50 0.50 039328 A 0.00 0.33 0.16 0.00 0.11 G 1.00 0.68 0.84 1.00 0.89 0.00 0.44 0.27 0.00 0.20 039470 C 0.54 0.34 0.20 0.27 0.34 G 0.46 0.66 0.80 0.73 0.66 0.50 0.45 0.33 0.39 0.45 039802 C 0.12 0.00 0.02 0.00 0.04 T 0.88 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 040055 - 0.17 0.00 0.02 0.00 0.05 + 0.83 1.00 0.98 1.00 0.95 0.28 0.00 0.04 0.00 0.09 040114 T 0.25 0.07 0.02 0.06 0.10 C 0.75 0.93 0.98 0.94 0.90 0.38 0.13 0.04 0.12 0.18 040150 G 0.09 0.27 0.11 0.15 0.16 C 0.91 0.73 0.89 0.85 0.84 0.17 0.40 0.20 0.25 0.26 040192 G 0.61 0.34 0.20 0.27 0.36 T 0.39 0.66 0.80 0.73 0.64 0.47 0.45 0.33 0.39 0.46 040310 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 040407 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 040674 G 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 040999 C 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 041185 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 041325 G 0.24 0.27 0.11 0.15 0.19 C 0.76 0.73 0.89 0.85 0.81 0.37 0.40 0.20 0.25 0.31 041410 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 041421 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 041550 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 041608 G 0.04 0.16 0.23 0.21 0.15 A 0.96 0.84 0.77 0.79 0.85 0.07 0.27 0.35 0.33 0.26 041614 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 041734 C 0.37 0.27 0.18 0.21 0.26 T 0.63 0.73 0.82 0.79 0.74 0.47 0.40 0.30 0.33 0.39 041795 G 0.00 0.00 0.05 0.06 0.03 A 1.00 1.00 0.95 0.94 0.97 0.00 0.00 0.09 0.12 0.05 041796 T 0.00 0.00 0.05 0.06 0.03 C 1.00 1.00 0.95 0.94 0.97 0.00 0.00 0.09 0.12 0.05 041967 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 042001 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 042079 - 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 + 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 042392 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 042542 T 0.26 0.07 0.30 0.02 0.16 C 0.74 0.93 0.70 0.98 0.84 0.38 0.13 0.42 0.04 0.28 042788 G 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 043171 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 043188 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 043247 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000599: A 000971: ca 004312: t 004415: a 005146: g 005178: gaaaga 008177: gcatatgtacc 008194: ttaaag 011234: AT 012431: attaa 012785: ag 013961: c 038743: t 040055: t 042079: a