Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000294 C 0.01 G 0.99 0.01 000721 C 0.01 T 0.99 0.01 000812 G 0.01 A 0.99 0.01 000835 A 0.07 T 0.93 0.12 000990 A 0.02 G 0.98 0.04 001119 A 0.02 G 0.98 0.04 001951 C 0.01 G 0.99 0.01 002103 C 0.01 T 0.99 0.01 002248 T 0.27 C 0.73 0.39 002294 A 0.01 G 0.99 0.01 002386 C 0.02 T 0.98 0.05 002570 T 0.01 C 0.99 0.01 002718 T 0.01 C 0.99 0.01 003089 G 0.03 A 0.97 0.05 003094 C 0.01 G 0.99 0.01 003129 A 0.01 G 0.99 0.01 003501 G 0.01 A 0.99 0.03 004884 T 0.01 G 0.99 0.02 005043 A 0.02 G 0.98 0.03 005046 A 0.01 G 0.99 0.01 005250 G 0.06 T 0.94 0.12 005855 T 0.01 C 0.99 0.01 005944 G 0.29 C 0.71 0.41 006939 A 0.01 G 0.99 0.01 007126 G 0.01 T 0.99 0.01 007208 + 0.02 - 0.98 0.04 007424 C 0.01 T 0.99 0.01 007471 T 0.01 C 0.99 0.01 007720 C 0.01 T 0.99 0.01 007922 C 0.02 A 0.98 0.03 007978 G 0.12 A 0.88 0.21 007992 T 0.03 C 0.97 0.05 008246 G 0.01 C 0.99 0.01 008253 + 0.01 - 0.99 0.01 008267 - 0.01 + 0.99 0.01 008283 A 0.06 C 0.94 0.12 008528 + 0.26 - 0.74 0.39 008975 G 0.01 A 0.99 0.02 009099 C 0.01 A 0.99 0.01 009268 G 0.01 A 0.99 0.01 009822 T 0.01 C 0.99 0.01 009844 G 0.01 A 0.99 0.01 009845 C 0.01 A 0.99 0.01 010240 G 0.01 A 0.99 0.02 012389 C 0.01 T 0.99 0.02 012393 A 0.01 T 0.99 0.01 012698 T 0.02 C 0.98 0.05 012831 C 0.01 A 0.99 0.02 013255 G 0.01 A 0.99 0.01 013454 C 0.21 T 0.79 0.34 013670 T 0.01 A 0.99 0.02 014189 T 0.01 C 0.99 0.01 014305 G 0.13 T 0.87 0.23 014476 C 0.02 G 0.98 0.03 014728 A 0.01 T 0.99 0.01 015066 G 0.01 A 0.99 0.01 015075 A 0.01 T 0.99 0.01 015478 A 0.01 G 0.99 0.01 016067 T 0.01 C 0.99 0.01 016204 + 0.05 - 0.95 0.10 016243 T 0.01 C 0.99 0.02 017781 A 0.01 G 0.99 0.01 017870 A 0.19 G 0.81 0.30 017883 C 0.01 G 0.99 0.02 017902 C 0.01 G 0.99 0.01 018134 C 0.01 T 0.99 0.01 018156 G 0.01 A 0.99 0.01 018197 A 0.01 G 0.99 0.01 018221 A 0.01 G 0.99 0.01 018278 T 0.01 G 0.99 0.01 018588 A 0.01 G 0.99 0.01 018663 T 0.04 C 0.96 0.08 018666 A 0.01 G 0.99 0.02 018681 + 0.01 - 0.99 0.01 018689 C 0.01 G 0.99 0.01 018822 T 0.01 A 0.99 0.01 019236 - 0.01 + 0.99 0.01 019427 G 0.01 A 0.99 0.01 019472 A 0.01 G 0.99 0.01 019612 T 0.02 A 0.98 0.03 020193 A 0.01 G 0.99 0.01 020341 T 0.01 C 0.99 0.01 020396 A 0.02 G 0.98 0.04 020479 T 0.01 A 0.99 0.01 021139 A 0.01 G 0.99 0.02 021159 T 0.01 C 0.99 0.02 021275 G 0.01 A 0.99 0.01 021287 G 0.01 A 0.99 0.01 021635 A 0.02 G 0.98 0.03 021717 A 0.01 G 0.99 0.01 021763 - 0.01 + 0.99 0.01 021870 - 0.01 + 0.99 0.02 021875 G 0.01 A 0.99 0.01 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 007208: GT 008253: T 008267: t 008528: aaatttt 016204: T 018681: T 019236: taga 021763: gca 021870: aa