Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000608 C 0.01 T 0.99 0.01 000700 G 0.03 A 0.97 0.05 001202 G 0.03 A 0.97 0.07 001227 A 0.06 T 0.94 0.12 001684 T 0.01 G 0.99 0.01 001775 A 0.01 G 0.99 0.01 002139 C 0.02 T 0.98 0.05 002145 C 0.02 T 0.98 0.04 002309 T 0.02 C 0.98 0.05 003192 T 0.01 C 0.99 0.01 003325 C 0.01 T 0.99 0.01 004298 A 0.01 G 0.99 0.01 004399 T 0.01 C 0.99 0.01 004415 C 0.01 G 0.99 0.01 004494 A 0.01 C 0.99 0.01 004789 G 0.27 A 0.73 0.39 005296 C 0.01 T 0.99 0.02 005340 A 0.01 G 0.99 0.02 005444 G 0.01 A 0.99 0.01 005452 A 0.01 G 0.99 0.01 005458 A 0.01 G 0.99 0.01 005835 A 0.01 T 0.99 0.02 005907 T 0.08 C 0.92 0.15 005946 T 0.01 C 0.99 0.01 006423 C 0.07 T 0.93 0.14 006619 C 0.02 T 0.98 0.03 006773 A 0.01 G 0.99 0.01 006998 T 0.01 A 0.99 0.01 007048 - 0.01 + 0.99 0.01 007454 T 0.01 C 0.99 0.01 007635 T 0.11 C 0.89 0.19 007770 G 0.01 A 0.99 0.01 008431 G 0.01 A 0.99 0.01 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 007048: T