Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000232 - 0.04 + 0.96 0.09 000294 G 0.01 A 0.99 0.01 000543 C 0.49 T 0.51 0.50 000780 C 0.01 A 0.99 0.01 000858 C 0.01 A 0.99 0.01 000936 A 0.03 G 0.97 0.05 001155 T 0.01 C 0.99 0.01 001213 C 0.01 G 0.99 0.01 001216 T 0.01 G 0.99 0.01 001332 A 0.15 G 0.85 0.26 001359 A 0.02 G 0.98 0.04 001381 T 0.01 C 0.99 0.01 001486 C 0.31 T 0.69 0.43 001737 T 0.32 C 0.68 0.43 001766 C 0.01 G 0.99 0.02 001926 G 0.30 A 0.70 0.42 002438 C 0.47 T 0.53 0.50 019143 T 0.03 C 0.97 0.05 019168 A 0.01 G 0.99 0.01 019253 G 0.01 T 0.99 0.01 019298 T 0.29 C 0.71 0.41 019984 T 0.03 A 0.97 0.07 020237 C 0.01 T 0.99 0.01 020377 T 0.29 C 0.71 0.41 020427 T 0.01 C 0.99 0.01 020535 A 0.01 G 0.99 0.02 020567 A 0.01 G 0.99 0.01 020579 T 0.29 C 0.71 0.41 020623 T 0.14 C 0.86 0.25 020883 C 0.28 T 0.72 0.41 021336 C 0.26 T 0.74 0.38 021340 G 0.26 A 0.74 0.38 021732 C 0.01 T 0.99 0.01 022424 G 0.28 C 0.72 0.40 022952 T 0.01 C 0.99 0.02 022998 C 0.01 G 0.99 0.02 023073 G 0.01 A 0.99 0.02 023106 - 0.20 + 0.80 0.32 023803 G 0.01 A 0.99 0.01 023865 T 0.01 A 0.99 0.01 024081 A 0.03 G 0.97 0.06 024331 C 0.01 G 0.99 0.01 024351 A 0.21 G 0.79 0.34 024463 T 0.31 C 0.69 0.43 024490 T 0.01 C 0.99 0.01 025069 T 0.29 C 0.71 0.41 025996 T 0.15 C 0.85 0.25 026069 C 0.03 T 0.97 0.05 026225 C 0.01 T 0.99 0.01 026429 C 0.01 G 0.99 0.01 026609 A 0.01 G 0.99 0.01 026659 C 0.30 T 0.70 0.42 027239 G 0.01 C 0.99 0.01 027310 A 0.02 G 0.98 0.05 027980 G 0.15 T 0.85 0.26 028007 A 0.29 G 0.71 0.41 028022 C 0.44 G 0.56 0.49 028301 T 0.28 C 0.72 0.41 028305 T 0.38 C 0.62 0.47 028470 G 0.38 A 0.62 0.47 028498 A 0.01 G 0.99 0.01 028621 + 0.01 - 0.99 0.02 028986 C 0.29 G 0.71 0.41 028997 T 0.02 C 0.98 0.04 029254 T 0.31 A 0.69 0.43 029270 G 0.01 T 0.99 0.01 029792 - 0.15 + 0.85 0.25 029834 C 0.01 T 0.99 0.01 029903 T 0.03 C 0.97 0.06 030182 A 0.03 G 0.97 0.06 035207 G 0.01 A 0.99 0.02 037249 T 0.01 A 0.99 0.01 039113 C 0.28 T 0.72 0.41 039181 G 0.02 A 0.98 0.04 039340 A 0.01 C 0.99 0.01 039562 T 0.02 C 0.98 0.03 039608 - 0.01 + 0.99 0.01 039751 G 0.01 A 0.99 0.01 039760 C 0.04 T 0.96 0.07 039856 - 0.18 + 0.82 0.30 039963 A 0.19 G 0.81 0.31 040020 C 0.30 T 0.70 0.42 040191 A 0.14 G 0.86 0.24 040211 A 0.01 G 0.99 0.01 042412 G 0.03 C 0.97 0.05 042517 T 0.01 C 0.99 0.01 042751 C 0.01 T 0.99 0.01 042935 T 0.01 C 0.99 0.02 042936 A 0.01 G 0.99 0.01 043429 G 0.04 T 0.96 0.08 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000232: AA 023106: CTG 028621: A 029792: T 039608: A 039856: TACTT