Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 001230 C 0.01 T 0.99 0.02 001366 C 0.01 G 0.99 0.02 001368 G 0.21 A 0.79 0.33 001619 T 0.01 C 0.99 0.01 002666 T 0.01 C 0.99 0.01 002932 G 0.01 C 0.99 0.02 003182 C 0.01 T 0.99 0.02 003344 G 0.01 T 0.99 0.01 003673 G 0.03 C 0.97 0.07 004301 G 0.22 A 0.78 0.35 004439 C 0.01 A 0.99 0.01 004605 T 0.01 C 0.99 0.01 005306 C 0.09 T 0.91 0.16 005753 + 0.08 - 0.92 0.15 006121 T 0.01 G 0.99 0.02 006144 A 0.01 G 0.99 0.02 006290 G 0.01 A 0.99 0.02 006342 C 0.01 T 0.99 0.01 007078 G 0.01 A 0.99 0.01 007497 G 0.01 A 0.99 0.01 007637 T 0.01 C 0.99 0.02 007986 A 0.01 G 0.99 0.02 007999 T 0.01 C 0.99 0.01 008526 A 0.02 T 0.98 0.04 009189 T 0.01 C 0.99 0.01 009395 A 0.01 G 0.99 0.01 009959 A 0.01 G 0.99 0.01 009973 C 0.01 T 0.99 0.01 010028 C 0.01 T 0.99 0.02 010859 T 0.01 C 0.99 0.01 011072 A 0.02 G 0.98 0.03 011208 T 0.01 C 0.99 0.01 011417 G 0.01 A 0.99 0.01 012878 C 0.01 G 0.99 0.01 012894 T 0.01 G 0.99 0.01 013084 - 0.09 + 0.91 0.16 013418 A 0.01 C 0.99 0.02 014704 T 0.01 C 0.99 0.01 014890 A 0.20 G 0.80 0.33 015082 T 0.01 G 0.99 0.02 015287 G 0.01 A 0.99 0.02 015518 G 0.01 A 0.99 0.02 016323 A 0.01 G 0.99 0.01 016645 A 0.01 C 0.99 0.01 016739 A 0.01 G 0.99 0.01 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 005753: T 013084: ctt