Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000052 C 0.29 T 0.71 0.41 000091 - 0.30 + 0.70 0.42 000294 G 0.01 T 0.99 0.01 000564 A 0.05 G 0.95 0.09 000648 A 0.18 G 0.82 0.29 000987 - 0.40 + 0.60 0.48 001184 G 0.06 T 0.94 0.11 001339 A 0.32 G 0.68 0.44 001398 T 0.01 C 0.99 0.02 001402 C 0.01 G 0.99 0.02 001435 T 0.31 C 0.69 0.43 001469 C 0.01 T 0.99 0.01 001471 - 0.01 + 0.99 0.01 002310 G 0.09 T 0.91 0.17 002584 A 0.01 C 0.99 0.02 003833 T 0.01 C 0.99 0.01 004080 G 0.01 A 0.99 0.01 004160 A 0.04 G 0.96 0.07 004322 A 0.01 T 0.99 0.01 004570 A 0.08 G 0.92 0.14 004715 A 0.04 G 0.96 0.09 004747 A 0.02 T 0.98 0.03 004793 A 0.02 T 0.98 0.03 005034 C 0.49 T 0.51 0.50 005084 T 0.01 C 0.99 0.01 005241 A 0.02 G 0.98 0.04 005330 - 0.01 + 0.99 0.01 005388 T 0.05 C 0.95 0.10 005515 T 0.01 A 0.99 0.01 005923 C 0.40 A 0.60 0.48 006215 A 0.39 G 0.61 0.48 006698 A 0.01 G 0.99 0.01 006762 C 0.06 T 0.94 0.11 006894 T 0.31 C 0.69 0.43 007194 C 0.31 G 0.69 0.43 007256 C 0.31 T 0.69 0.42 007284 C 0.01 T 0.99 0.01 007382 A 0.01 G 0.99 0.01 007420 T 0.01 C 0.99 0.01 007793 A 0.01 G 0.99 0.01 008067 C 0.01 T 0.99 0.01 008245 G 0.01 A 0.99 0.01 008412 G 0.07 C 0.93 0.13 008504 C 0.10 T 0.90 0.17 008905 A 0.10 G 0.90 0.17 009099 G 0.29 A 0.71 0.42 009133 T 0.02 C 0.98 0.03 009218 A 0.02 G 0.98 0.03 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000091: G 000987: C 001471: G 005330: AA