Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop 000059 G 2 A 150 000224 C 1 T 153 000539 - 3 + 149 000561 T 4 C 154 000638 G 2 A 156 000838 C 14 G 150 000894 A 2 C 162 000917 C 1 T 163 001269 A 6 G 158 001312 C 3 G 165 001632 A 3 G 161 001738 A 3 G 109 002059 A 3 G 165 002149 G 72 A 92 002461 T 2 C 176 002681 A 1 C 169 002761 A 3 G 167 002773 T 3 C 167 002793 T 3 C 165 002849 A 65 G 103 002857 T 7 A 161 002965 C 11 G 151 003114 A 5 G 153 003392 + 1 - 173 003408 C 1 T 175 003577 T 6 C 172 003604 A 70 G 108 003634 G 67 A 109 003661 T 2 C 176 003751 G 3 A 165 003752 C 2 A 166 003941 C 84 T 90 003988 - 1 + 177 004199 A 3 G 177 004576 A 1 T 177 004754 T 3 C 169 004831 C 1 G 173 004891 A 3 G 173 005305 A 3 G 177 005566 C 1 T 177 005954 T 8 C 150 006227 A 68 C 112 006441 T 1 C 177 006529 G 1 C 177 006617 C 1 T 179 006711 T 4 C 170 006755 G 15 A 155 007365 + 1 - 167 007574 A 2 G 178 007576 - 1 + 179 007617 G 10 A 166 007669 A 1 G 175 007696 A 1 G 173 007927 A 1 G 177 007954 A 3 G 175 008113 T 3 C 175 008242 T 1 C 179 008404 A 2 T 168 008409 G 2 C 168 008459 G 3 A 167 008471 G 4 A 166 008481 T 3 G 167 008665 G 1 C 163 008924 G 1 T 167 009083 T 16 C 154 009170 A 2 G 172 009250 C 16 T 162 009391 A 2 T 172 009455 C 1 T 173 009849 A 15 G 157 009931 T 6 C 166 010085 G 1 A 179 010113 G 2 A 178 010337 T 1 C 179 010413 G 1 A 179 010539 A 2 G 176 011411 C 80 T 94 011412 T 80 C 94 011420 T 1 C 175 011697 A 3 G 175 011897 A 1 G 175 011935 T 2 A 174 012057 C 2 T 172 012104 C 77 T 97 012651 T 3 C 175 012685 T 3 C 177 012774 G 1 T 173 012821 C 2 T 172 013035 G 56 A 122 013208 C 1 T 177 013225 C 56 T 122 013274 A 1 G 173 013361 - 1 + 177 013367 G 1 A 179 013415 C 1 A 179 013657 T 2 A 174 014564 A 52 C 118 014619 C 2 G 172 014753 T 1 C 173 014763 C 2 G 172 014874 T 1 C 169 015436 T 1 C 179 015561 T 2 C 178 015649 C 1 A 179 015676 T 59 C 119 015971 G 65 A 115 016090 C 1 T 177 016263 + 3 - 165 016284 T 25 C 155 016452 + 1 - 175 016662 A 1 C 177 016803 C 75 T 103 016882 A 2 G 176 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000539: TA 003392: TA 003988: A 007365: A 007576: GTGGATCATAAGG 013361: ATGT 016263: TCA 016452: TCGTT