Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop 000087 A 65 G 109 000092 T 1 C 175 000107 T 6 G 170 000159 C 9 T 167 000160 C 1 T 175 000170 T 2 C 174 000216 T 65 C 109 000291 C 65 T 109 000295 T 1 C 175 000296 A 1 G 175 000315 C 29 A 145 000324 T 1 C 175 000333 T 9 C 165 000564 A 66 G 112 000652 A 66 T 112 000822 G 6 A 174 000893 A 2 G 176 000909 G 1 A 171 001088 + 61 - 115 001095 T 1 C 177 001173 A 52 T 124 001260 G 80 T 96 001419 A 61 T 113 001451 G 27 T 147 001475 A 65 T 111 001615 A 63 G 111 001639 A 59 C 115 001698 G 59 A 115 001744 G 59 A 113 001759 T 59 C 115 001769 G 58 A 114 001888 G 63 A 111 002048 A 1 T 171 002286 A 49 G 103 002362 T 49 A 101 002605 T 1 C 147 002735 C 1 T 153 002888 G 35 C 117 002899 G 75 C 77 002969 G 2 A 150 003050 C 2 T 150 003876 C 28 T 138 003907 C 55 T 111 004140 G 56 T 112 004177 G 47 A 93 005003 G 56 C 114 005027 A 58 C 116 005159 C 2 G 174 005427 T 53 G 117 005428 A 53 G 117 005445 G 1 C 169 005457 C 55 T 117 005503 G 1 C 175 005544 A 3 G 177 005563 A 58 T 122 005807 T 1 C 171 005871 T 56 C 120 006016 G 1 C 175 006023 T 57 C 119 006132 C 1 T 175 006145 C 4 G 170 006158 G 55 A 119 006247 G 1 C 173 006363 A 2 T 170 006383 G 2 C 178 006506 T 1 G 177 006727 G 57 A 119 006887 G 1 T 177 007032 T 81 C 89 007243 C 55 G 123 007254 T 1 C 177 007290 A 1 G 177 007328 A 51 C 127 007351 T 86 C 92 007616 + 54 - 124 007756 C 1 G 177 007912 T 1 C 167 008081 T 53 G 115 008124 A 29 G 137 008322 T 4 A 140 008323 T 46 A 100 008340 T 1 C 157 008346 A 48 G 108 008375 G 27 A 131 008481 A 1 G 157 008595 C 81 A 87 008610 G 1 A 173 008635 G 1 A 171 008763 A 55 G 117 008807 T 1 A 177 008808 C 56 T 118 008890 G 54 A 120 008919 G 29 A 147 009026 G 50 C 126 009235 C 1 A 137 009258 + 20 - 114 009324 C 1 G 167 009439 G 83 T 93 009671 G 1 A 173 009787 G 5 A 173 010176 G 38 A 138 010196 G 52 C 126 010218 G 1 C 177 010279 C 57 T 121 010736 G 1 T 169 010958 A 1 G 171 011391 C 45 T 117 011404 G 2 T 164 011513 T 56 G 114 011767 T 2 G 174 011991 T 2 C 170 012015 G 1 C 167 012265 G 8 A 168 012266 G 2 A 174 012392 T 1 C 175 012777 A 2 G 174 012843 A 1 G 179 012876 T 31 C 149 012891 A 1 G 179 012903 T 2 C 178 012923 C 89 T 91 013160 G 1 A 173 013227 A 1 C 173 013325 T 57 G 117 013397 G 57 T 117 013436 - 3 + 169 013483 T 4 C 168 013598 G 57 A 115 013663 C 57 G 115 016716 G 20 C 104 016824 T 41 C 95 017013 G 1 C 131 017136 A 37 G 83 017511 A 4 G 172 017578 T 33 G 145 017587 T 1 C 177 017592 G 33 C 145 017676 C 1 A 177 017716 T 57 A 121 017962 G 1 A 177 017969 T 2 C 176 018109 T 52 C 126 018250 A 1 G 173 018323 C 50 T 124 018712 C 1 G 175 018722 C 1 T 175 018810 T 1 C 175 018877 T 4 G 170 018888 G 86 A 88 018927 C 6 T 168 018963 A 85 C 95 019105 C 2 T 154 019303 G 23 A 133 019457 A 1 G 155 019573 C 1 T 153 019683 A 75 G 79 019900 G 1 A 167 019965 A 2 G 142 020034 T 3 C 147 020059 A 69 G 81 020085 T 5 C 147 020165 G 74 A 78 020205 A 1 T 151 020434 G 1 A 153 020831 A 32 G 36 020868 - 68 + 78 021013 C 8 T 98 021550 G 41 A 99 021592 G 6 T 154 021656 G 80 C 88 021842 C 63 T 105 022674 + 2 - 174 022828 A 70 G 108 022985 G 1 A 175 023001 C 61 T 115 023022 A 21 G 155 023041 A 81 G 93 023499 A 1 G 173 023526 - 81 + 93 024869 T 1 C 161 024999 G 61 C 105 025082 C 61 T 105 025259 G 25 A 121 025556 G 1 A 101 025707 A 1 G 101 026144 G 49 T 97 026161 T 50 C 94 026288 C 2 G 144 026442 G 1 A 91 026959 C 6 T 158 027089 A 63 T 67 027243 T 59 A 109 027260 G 6 T 164 027414 C 64 T 108 027476 G 67 T 109 027847 T 66 C 110 027863 C 20 T 156 027904 C 82 T 82 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001088: TG 007616: A 009258: A 013436: A 020868: AG 022674: A 023526: G