Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000274 A 0.01 G 0.99 0.01 000392 G 0.01 C 0.99 0.01 000530 A 0.01 C 0.99 0.01 001140 T 0.15 C 0.85 0.25 001244 A 0.01 C 0.99 0.01 001351 A 0.09 G 0.91 0.16 001569 T 0.02 C 0.98 0.03 001671 T 0.01 G 0.99 0.01 001741 T 0.01 G 0.99 0.01 001743 C 0.01 G 0.99 0.02 001847 T 0.01 C 0.99 0.01 001979 T 0.09 G 0.91 0.16 002041 A 0.01 G 0.99 0.01 002089 A 0.01 G 0.99 0.02 002156 G 0.26 A 0.74 0.38 002602 T 0.01 C 0.99 0.01 002752 G 0.01 A 0.99 0.01 003043 C 0.01 T 0.99 0.01 013419 C 0.12 T 0.88 0.20 013451 T 0.28 G 0.72 0.40 013544 A 0.01 C 0.99 0.01 013716 T 0.01 C 0.99 0.01 013956 A 0.01 G 0.99 0.02 013957 C 0.15 T 0.85 0.26 014132 C 0.01 T 0.99 0.02 014382 A 0.26 G 0.74 0.39 014451 G 0.16 A 0.84 0.26 014507 T 0.11 C 0.89 0.20 014543 A 0.01 G 0.99 0.01 014944 A 0.01 C 0.99 0.01 015022 T 0.12 G 0.88 0.20 015247 A 0.01 G 0.99 0.01 015396 T 0.01 C 0.99 0.01 015668 T 0.01 C 0.99 0.01 016009 A 0.02 G 0.98 0.03 016425 A 0.08 T 0.92 0.15 023090 G 0.01 A 0.99 0.01 023173 C 0.01 T 0.99 0.01 023985 T 0.01 C 0.99 0.01 030489 A 0.01 G 0.99 0.01 030800 G 0.01 T 0.99 0.01 030802 G 0.01 A 0.99 0.01 030949 A 0.01 G 0.99 0.01 031060 C 0.11 T 0.89 0.20 031101 G 0.41 A 0.59 0.48 031207 T 0.01 C 0.99 0.01 031286 G 0.01 C 0.99 0.02 031340 G 0.01 A 0.99 0.01 031456 A 0.01 C 0.99 0.02 031458 T 0.12 C 0.88 0.22 031722 G 0.03 A 0.97 0.06 031908 A 0.03 T 0.97 0.06 032235 T 0.05 C 0.95 0.10 032497 G 0.01 C 0.99 0.01 032825 - 0.13 + 0.87 0.23 034151 G 0.25 T 0.75 0.37 034279 A 0.40 G 0.60 0.48 034366 T 0.01 G 0.99 0.02 034567 G 0.01 A 0.99 0.01 034575 C 0.14 T 0.86 0.25 034832 G 0.01 A 0.99 0.01 034882 - 0.01 + 0.99 0.01 035089 A 0.01 G 0.99 0.01 035263 A 0.13 G 0.87 0.23 035388 T 0.01 C 0.99 0.01 035434 T 0.02 C 0.98 0.03 035689 G 0.03 A 0.97 0.06 036173 T 0.01 C 0.99 0.01 036623 T 0.01 A 0.99 0.01 036849 T 0.15 C 0.85 0.26 037502 A 0.12 T 0.88 0.21 042113 A 0.01 G 0.99 0.01 042131 C 0.13 T 0.87 0.23 042142 C 0.01 A 0.99 0.01 042155 A 0.16 C 0.84 0.27 042785 G 0.09 T 0.91 0.17 043198 A 0.17 G 0.82 0.29 043278 C 0.01 G 0.99 0.01 043870 A 0.01 G 0.99 0.01 044034 G 0.16 A 0.84 0.27 044405 T 0.01 C 0.99 0.01 044464 G 0.18 T 0.82 0.30 044568 T 0.01 C 0.99 0.02 044720 T 0.01 C 0.99 0.02 044909 - 0.09 + 0.91 0.16 044916 - 0.16 + 0.84 0.26 045096 G 0.38 C 0.62 0.47 045681 C 0.02 A 0.98 0.03 045794 T 0.01 A 0.99 0.01 045804 T 0.16 A 0.84 0.27 046124 G 0.13 A 0.87 0.23 046172 T 0.05 C 0.95 0.10 046471 T 0.26 C 0.74 0.39 046615 - 0.21 + 0.79 0.33 046832 G 0.07 A 0.93 0.12 047112 A 0.12 G 0.88 0.21 047315 C 0.01 A 0.99 0.02 047730 - 0.33 + 0.67 0.44 047886 G 0.02 A 0.98 0.03 047960 A 0.01 C 0.99 0.01 048010 T 0.10 C 0.90 0.17 048156 C 0.16 T 0.84 0.26 048515 A 0.01 G 0.99 0.01 048572 C 0.02 T 0.98 0.03 048874 G 0.17 A 0.83 0.28 048933 - 0.01 + 0.99 0.02 049633 C 0.17 T 0.83 0.28 050116 G 0.01 C 0.99 0.01 050292 G 0.48 A 0.52 0.50 051143 T 0.01 C 0.99 0.01 051377 G 0.02 A 0.98 0.05 051398 A 0.43 G 0.57 0.49 051812 T 0.17 C 0.83 0.29 051849 T 0.01 C 0.99 0.01 051959 A 0.02 G 0.98 0.03 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 032825: G 034882: TGAAACATT 044909: GT 044916: TAAGT 046615: GT 047730: A 048933: TAATA