Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000251 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000577 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 000964 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 001069 T 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 001225 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 001526 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001566 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001769 C 0.25 0.00 0.00 0.00 0.07 G 0.75 1.00 1.00 1.00 0.93 0.38 0.00 0.00 0.00 0.14 001793 G 0.25 0.00 0.00 0.00 0.07 C 0.75 1.00 1.00 1.00 0.93 0.38 0.00 0.00 0.00 0.13 002067 T 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 002071 G 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 T 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 002533 C 0.12 0.23 0.05 0.07 0.12 T 0.88 0.77 0.95 0.93 0.88 0.22 0.35 0.10 0.12 0.21 002848 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 003724 A 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 G 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 003809 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 004091 G 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 004104 T 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 004192 G 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 A 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.05 0.00 0.02 004202 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 004414 + 0.26 0.00 0.00 0.02 0.08 - 0.74 1.00 1.00 0.98 0.92 0.38 0.00 0.00 0.04 0.15 004797 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 004923 C 0.15 0.26 0.11 0.09 0.15 A 0.85 0.74 0.89 0.91 0.85 0.25 0.39 0.20 0.16 0.25 005709 A 0.00 0.07 0.02 0.00 0.02 G 1.00 0.93 0.98 1.00 0.98 0.00 0.13 0.05 0.00 0.04 005879 A 0.00 0.07 0.05 0.00 0.03 G 1.00 0.93 0.95 1.00 0.97 0.00 0.13 0.09 0.00 0.05 006074 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 006122 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 006168 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 006217 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 006631 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 007442 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 007705 A 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 G 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 008483 G 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 008552 C 0.20 0.00 0.00 0.04 0.07 T 0.80 1.00 1.00 0.96 0.93 0.32 0.00 0.00 0.08 0.13 008594 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 009220 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 009351 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 009664 T 0.24 0.00 0.00 0.00 0.07 G 0.76 1.00 1.00 1.00 0.93 0.37 0.00 0.00 0.00 0.13 010528 T 0.61 0.25 0.30 0.42 0.41 C 0.39 0.75 0.70 0.58 0.59 0.48 0.38 0.42 0.49 0.48 010802 G 0.24 0.00 0.00 0.00 0.07 T 0.76 1.00 1.00 1.00 0.93 0.37 0.00 0.00 0.00 0.13 010996 T 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.25 0.00 0.00 0.00 0.08 011306 G 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 A 1.00 1.00 1.00 0.92 0.98 0.00 0.00 0.00 0.15 0.04 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 004414: cttt