************************************************************* **** **** **** Output from PHASE v2.0 **** **** Code by M Stephens, with contributions from N Li **** **** **** ************************************************************* BEGIN COMMAND_LINE /usr/local/genome/lib/phase/PHASE2 -d1 ald1a.phase.inp ald1a.phase.out END COMMAND_LINE BEGIN OUTFILE_LIST ald1a.phase.out_freqs : haplotype frequency estimates ald1a.phase.out_pairs : most likely haplotype pairs for each individual ald1a.phase.out_recom : estimates of recombination parameters ald1a.phase.out_monitor : file for monitoring convergence END OUTFILE_LIST BEGIN INPUT_SUMMARY Number of Individuals: 90 Number of Loci: 70 Positions of loci: 1049 3880 4863 4915 6312 8083 8995 9003 10020 10051 10300 10831 12862 12960 13170 16916 16970 17248 17495 17736 17959 18569 19128 19194 20010 20060 22258 22701 23988 24232 24414 24731 24801 24811 24939 25074 25480 25572 25833 25897 26630 27931 29595 29686 30796 32283 32575 35113 36549 37227 37243 37269 38952 39319 39494 39986 43939 43999 45094 45187 47940 48206 49903 50627 52296 52567 53002 54332 54424 54553 END INPUT_SUMMARY List of haplotypes found in best reconstruction, with counts. (See file ald1a.phase.out_freqs for haplotype population frequency estimates) BEGIN LIST_SUMMARY 1 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCCCAGTCCGTGTAT 45.000000 2 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCCCAGTCCGTGCAT 11.000000 3 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCCCAGTCGTTTTAT 1.000000 4 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCCCAGTTCGTGTAT 2.000000 5 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCTAAATTGTTTTAT 7.000000 6 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCTAAATTGTTTTGT 1.000000 7 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCTAAATTGTCTTGC 1.000000 8 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGTCCAGTCGTTTTAT 2.000000 9 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCCGICCCDACTAAATTGGTGTAT 1.000000 10 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITAITCGCCTADTCGDGCTAGACCGTTTTAT 1.000000 11 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACCTACACGCAATICCITCACCCGICCCDACCCAGTCCGTGCAT 1.000000 12 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATCGTTTTAT 1.000000 13 CGTGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGTTTTAT 2.000000 14 CGTGAGAAAAAGGTTGTCCCGGGCIAACCTACTCGCGATICCITCGCCTADTCGDGCTAGATCGTCTTGC 1.000000 15 CGTGAGAAAAAGGTTGTCCCGGGCIAACCTACTCGCGATICCITCGCCTADTCGDGCTAGACCGTCTTGC 1.000000 16 CGTGAGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATCGGTGTAT 2.000000 17 CGTGATGCGAAGACCCCGGCAATTIGACCTACTAGTGATDCCITCACCCGICCCDACTAAATTGTTTTAT 14.000000 18 CGTGGGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGDGCCCAGTCCGTGCAT 1.000000 19 CGTGGGAAAAAGGTTGTCCCGGGCIAAGCTACTAGTGATICCITCACCTGICCGDACCAAACCGTTTTAT 1.000000 20 CGTGGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGGTGTAT 1.000000 21 CGTGGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGTTTTAT 2.000000 22 CGTGGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGTTTTGT 4.000000 23 CGTGGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGTCTTGC 7.000000 24 CGTGGGAAAGACATCGCGGCGGTCIAAGCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGTCCAGTCGTTTTAT 1.000000 25 CGTAGGAAAACGATCCCGGCAATTDAACCTACTAGTGATDCCITCACACGICCCDACTAAATTGTTTTAT 1.000000 26 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCCCAGTCCGTGTAT 1.000000 27 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTGCAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGTTTTAT 1.000000 28 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGTCCAGTCGTTTTAT 1.000000 29 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCDCTACCTGICCGIGCTAGACCGTTTTAT 1.000000 30 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCTGICCGDACCAAACCGTTTTAT 1.000000 31 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICGCIGCCAAATTGTTTTAT 1.000000 32 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCIACTAAATTGGTGCAT 1.000000 33 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACCCAGTCCGTGCAT 1.000000 34 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTCGTGCAT 3.000000 35 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGGTTTGT 1.000000 36 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGGTGCAT 4.000000 37 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGTTTTAT 24.000000 38 CGTAGGAAAGACATCGCGGTAGTCIAAGCTACTAGTGATICCITCACCTADTCGDGCTAGACCGTCTTGC 1.000000 39 CGTAGGAAAGACATCGCGGCGGTCIAAGCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGTCCAGTCCTTTTAT 2.000000 40 CGTAGGAAAGACATCGCGGCGGTCIAAGCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGTCCAGTCGTTTTAT 1.000000 41 CATGGGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGCCCAGTCGTTTTAT 1.000000 42 CATGGGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGTCCAGTCGTTTTAT 1.000000 43 CATGGGGAAACGATCCCGGCAATTDAACCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGIGCTAGACCGTTTTAT 1.000000 44 CATGGGGAAACGATCCCGGCAATTDAACCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGCTAGACCGTTTTGT 1.000000 45 CATGGGGAAACGGTTGCGGCGGTCIAAGCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGCCCAGTCCGTGTAT 1.000000 46 CATGGGGAAACGGTTGCGGCGGTCIAAGCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGCTAAATTGGTGTGT 1.000000 47 CATGGGGAAACGGTTGCGGCGGTCIAAGCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGTCCAGTCCTTTTAT 1.000000 48 CATGGGGAAACGGTTGCGGCGGTCIAAGCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGTCCAGTCGTTTTAT 1.000000 49 CATGGGGAAAAGGTTGCGGCGGTCIAAGCTACTCGCGATITCITCGCCTADTCGDGCTAGACCGTTTTAT 2.000000 50 CATGGGGAAGACATCGCGGTAATTIAGGCTACAAGTAATICCITCACCTGICCGIGCTAGACCGTTTTAT 1.000000 51 TGAGAGGAAACGATCCCGGCAATTDAACTGGATCATGTAITADCTACCTGICGGIGTCCGGTCGGTTTGT 1.000000 52 TGAGGGAAAAAGGTTGCGGCAATTIGACCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTCTTTTAT 3.000000 53 TGAGGGAAAAAGGTTGCGGCAATTIGACCTACAAGTAATICCITCACCCGICCCDACTAAATTGTTTTAT 1.000000 54 TGAGGGAAAAAGGTTGTCCCGGGCDAAGCTACTAGTGATICCITCACCTADTCGDGCCAAATTGTTTTAT 2.000000 55 TGAGGGAAAAAGGTTGTCCCGGGCIAACCTACTCGCGATICCITCGTATGICCGDGTCCAGTCCTTTTAT 1.000000 56 TGAGGGAAAAAGGTTGTCCCGGGCIAACCTACTAGTGATDCCITCGCATGICCGDGCTAGACCGTTTTGT 1.000000 57 TGAGGGAAAAAGGTTGTCCCGGGCIAAGCTACTAGTGATICCITCGCATGICCGDGCTAAATTGTTTTAT 1.000000 58 TGAGGGAAAAAGGTTGTCCCGGGCIAAGCTACTAGTGATDCCITCACCTADTCGDGCCCAATCCGTTTGT 3.000000 END LIST_SUMMARY Summary of best reconstruction (numbers refer to the list of haplotypes given above) BEGIN BESTPAIRS_SUMMARY P001: (1,1) P002: (34,37) P003: (5,49) P004: (17,41) P005: (1,1) P006: (17,17) P007: (6,22) P008: (2,37) P009: (1,52) P010: (17,23) P011: (10,13) P012: (1,17) P013: (8,9) P014: (1,1) P015: (1,27) P016: (34,36) P017: (14,56) P018: (37,48) P019: (17,52) P020: (1,17) P021: (2,37) P022: (1,31) P023: (22,40) P024: (33,37) P025: (1,2) P026: (2,36) P027: (1,2) P028: (7,17) P029: (25,50) P030: (1,5) P031: (17,47) P032: (22,42) P033: (1,12) P034: (1,5) P035: (1,37) P036: (2,37) P037: (36,37) P038: (43,58) P039: (1,37) P040: (21,23) P041: (51,54) P042: (29,30) P043: (1,1) P044: (1,20) P045: (1,32) P046: (1,1) P047: (34,36) P048: (23,23) P049: (1,37) P050: (1,37) P051: (1,53) P052: (1,1) P053: (1,35) P054: (5,24) P055: (13,21) P056: (17,57) P057: (46,58) P058: (1,11) P059: (37,54) P060: (1,23) P061: (44,45) P062: (1,2) P063: (37,39) P064: (8,37) P065: (15,49) P066: (16,37) P067: (1,16) P068: (1,5) P069: (4,37) P070: (37,37) P071: (26,37) P072: (3,5) P073: (1,39) P074: (2,2) P075: (2,18) P076: (37,37) P077: (17,23) P078: (2,17) P079: (1,4) P080: (1,1) P081: (1,23) P082: (5,22) P083: (1,17) P084: (1,17) P085: (1,1) P086: (37,52) P087: (28,58) P088: (37,55) P089: (19,38) P090: (1,37) END BESTPAIRS_SUMMARY Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in []: BEGIN BESTPAIRS1 0 P001 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T 0 P002 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T C G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P003 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C T A A A T T G T T T T A T C A T G G G G A A A A G G T T G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I T C I T C G C C T A D T C G D G C T A G A C C G T T T T A T 0 P004 C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C A T G G G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C G T T T T A T 0 P005 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T 0 P006 C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P007 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C T A A A T T G T T T T G T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T G T 0 P008 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P009 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T T G A G G G A A A A A G G T T G C G G C A A T T I G A C C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T C T T T T A T 0 P010 C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T [C] T T G [C] 0 P011 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A I T C G C C T A D T C G D G C T A G A C C G T T T T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P012 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P013 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G T C C A G T C G (T) T (T) T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C C G I C C C D A C T A A A T T G (G) T (G) T A T 0 P014 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T 0 P015 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T G C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P016 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T C G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G G T G C A T 0 P017 C G T G A G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A C C T A C T C G C G A T I C C I T C G C C T A D T C G D G C T A G A T C G T C T T G C T G A G G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A C C T A C T A G T G A T D C C I T C G C A T G I C C G D G C T A G A C [C] G T T T T G T 0 P018 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C A T G G G G A A A C G G T T G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G [T] C C A G T C G T T T T A T 0 P019 C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T T G A G G G A A A A A G G T T G C G G C A A T T I G A C C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T [C] T T T T A T 0 P020 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T [G] T A T C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P021 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P022 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G (G) I G C C (C) A (G) T (C) (C) (G) T (G) T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C G (C) I G C C (A) A (A) T (T) (G) (T) T (T) T A T 0 P023 C G T (G) G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T G T C G T (A) G G A A A G A C A T C G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G T C C A G T C G T T T T A T 0 P024 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C C C A G T C C G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P025 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T 0 P026 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G G T G C A T 0 P027 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T 0 P028 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C T A A A T T G T (C) T T (G) (C) C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T (T) T T (A) (T) 0 P029 C G T A G G A A A A C G A T C C C G G C A A T T [D] [A] A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C A [C] G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C A T G G G G A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C [T] G I C C G I G C T A G A C C G T T T T A T 0 P030 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C T A A A T T G T T T T A T 0 P031 C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C A T G G G G A A A C G G T T G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G T C C A G T C C T T T T A T 0 P032 C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T G T C A T G G G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G T C C A G T C G [T] T T T A T 0 P033 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A [A] T C G T T T T A T 0 P034 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C T A A A T T G T T T T A T 0 P035 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P036 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P037 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T [G] G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P038 C A T G G G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G I G C T A G A C C G T T T T A T T G A G G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A G C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C T A D T C G D G C C C A A T C C G T T T G T 0 P039 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P040 C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T C T T G C 0 P041 T G A G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G T C C G G T C G G T T T G T T G A G G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C D A A G C T A C T A G T G A T I C C I T C A C C T A D T C G D G C C A A A T T G T T T T A T 0 P042 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C (D) (C) (T) A C C T G I C C G I G C T A G A C C G T T T T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C (I) (T) (C) A C C T G I C C G D A C C A A A C C G T T T T A T 0 P043 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T 0 P044 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G G T G T A T 0 P045 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C I A C T A A A T T [G] G T G C A T 0 P046 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T 0 P047 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T C G T G C A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G G T G C A T 0 P048 C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T C T T G C C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T C T T G C 0 P049 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P050 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P051 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T T G A G G G A A A A A G G T T G C G G C A A T T I G A C C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P052 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T 0 P053 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T [T] [G] G T T T G T 0 P054 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C [T] [A] A [A] T [T] G T T T T A T C G T G [G] G A A A G A C A T C G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G T C C A G T C [G] T T T T A T 0 P055 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P056 C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T (D) C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T T G A G G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A G C T A C T A G T G A T (I) C C I T C G C A T G I C C G D G C T A A A T T G T T T T A T 0 P057 C A T G G G G A A A C G G T T G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G C T A A A T T G G T G [T] G T T G A G G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A G C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C T A D T C G D G C C C A A T C C G T T T G T 0 P058 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C C T A C A C G C [A] A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C [C] [C] A [G] T C C G T G C A T 0 P059 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T T G A G G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C D A A G C T A C T A G T G A T I C C I T C A C C T A D T C G D G C C A A A T T G T T T T A T 0 P060 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T C T T G C 0 P061 C A T G G G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C C T A C T C G [C] G A T I C C I T C G [T] A T G I C C G D G C T A G A C [C] G T T T T G T C A T G G G G A A A C G G T T G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G C C C A G T C C G T G T A T 0 P062 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T 0 P063 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G T C C A G T C [C] T T T T A T 0 P064 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G T C C A G T C G T T T T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P065 C G T G A G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A C C T A C T C G C G A T I C C I T C G C C T A D T C G D G C T A G A C C G T C T T G C C A T G G G G A A A A G G T T G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I T C I T C G C C T A D T C G D G C T A G A C C G T T T T A T 0 P066 C G T G A G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T C G G T G [T] A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P067 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T G A G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T C G G T G [T] A T 0 P068 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C T A A A T T G T T T T A T 0 P069 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T T C G T G T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P070 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P071 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P072 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C G T T T T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C T A A A T T G T T T T A T 0 P073 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G C G G T C I A A G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G T C C A G T C C T T T T A T 0 P074 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T 0 P075 C G T G (A) G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T C G T G (G) G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G D G C C C A G T C C G T G C A T 0 P076 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P077 C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T C T T G C 0 P078 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G C A T C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P079 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T T C G T G T A T 0 P080 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T 0 P081 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T C T T G C 0 P082 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C T A A A T T G T T T T (A) T C G T G G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T (G) T 0 P083 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G [T] A T C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P084 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A T G C G A A G A C C C C G G C A A T T I G A C C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T 0 P085 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T 0 P086 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T T G A G G G A A A A A G G T T G C G G C A A T T I G A C C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T C T T T T A T 0 P087 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G T C C A G T C G T T T T A T T G A G G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A G C T A C T A G T G A T D C C I T C A C C T A D T C G D G C C C A A T C C G T T T G T 0 P088 C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T T G A G G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A C C T A C T C G C G A T I C C I T C G T A T G I C C G D G T C C A G T C C T T T T A T 0 P089 C G T (G) G G A A A A A G G T T G T C C C G G G C I A A G C T A C T A G T G A T I C C I T C A C C T G I C C G D A C C A A A C C G T T T T A T C G T (A) G G A A A G A C A T C G C G G T A G T C I A A G C T A C T A G T G A T I C C I T C A C C T A D T C G D G C T A G A C C G T C T T G C 0 P090 C G T G A G G A A A C G A T C C C G G C A A T T D A A C T G G A T C A T G T A I T A D C T A C C T G I C G G I G C C C A G T C C G T G T A T C G T A G G A A A G A C A T C G C G G T A A T T I A G G C T A C A A G T A A T I C C I T C A C C C G I C C C D A C T A A A T T G T T T T A T END BESTPAIRS1 Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in [] with phase known positions indicated by = BEGIN BESTPAIRS2 0 P001 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = ? 0 P002 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = ? ? ? ? ? ? ? = = = = ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = C G ? ? C ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = ? ? ? ? ? ? ? = = = = ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = G T ? ? T ? ? 0 P003 = G = = A = = = = = C = A = C C = = = = ? A = T D = = C T G G A = = A T = T A = ? A D C T A = = = G I C G = I = = = = A = T T = = = = = = ? = A = = G = = = = = A = G = T G = = = = ? G = C I = = G C T A C = = G C = A T = ? C I T C G = = = A D T C = D = = = = G = C C = = = = = = ? 0 P004 = G = = A T = C G = A = = C = = = = = = ? = = = I G = = C ? A C = A G = = A ? ? ? C I T C = = = C = = = ? C D ? = T A = A ? ? = = = = = = = = A = = G G = A A = C = = T = = = = = = ? = = = D A = = T ? G A = C A = = T ? ? ? A D C T = = = T = = = ? G I ? = C C = G ? ? = = = = = = = 0 P005 = ? = = ? = = = = = = = ? ? = ? ? ? ? = ? = = = = = = = = ? ? = = = = = ? ? = = = ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = ? ? = ? ? ? ? = ? = = = = = = = = ? ? = = = = = ? ? = = = ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P006 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = 0 P007 = ? = = A = ? = = A C G = = = C = = = C ? = = = D = A C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I G = = = ? = = ? = = = ? = = = = ? = = G = ? = = G A C = = = G = = = T ? = = = I = G G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D A = = = ? = = ? = = = ? = = = 0 P008 = = = G A = G = = A C G = = = C = = = C ? = = = D = A C T G G A T C A = G T A = ? A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = ? ? G = ? C = = = = = A G = A = = G A C = = = G = = = T ? = = = I = G G C T A C A A G = A A T = ? C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = ? ? T = ? T = = 0 P009 C ? T = A = ? ? = = C = A = ? C = = = = ? = = = D A ? = T G G A T C A = ? T ? ? ? A D C T = = = T = = = G ? I G = C C = G = C = ? ? ? ? ? ? T ? A = G = ? ? = = A = G = ? G = = = = ? = = = I G ? = C T A C A A G = ? A ? ? ? C I T C = = = C = = = C ? D A = T A = A = T = ? ? ? ? ? ? 0 P010 = = = = A ? G ? G A = G = C ? C = = = C = ? = = = G A C = = = = T = = = G = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? ? ? = A ? = = = = G ? A ? A G = C = T ? G = = = T = ? = = = A G G = = = = A = = = A = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? ? ? = G ? 0 P011 = = = = = = = = ? ? = = ? ? = = = = = = = = = = ? ? = = T G G A T C A = G T A = T A = = = G = = T A D ? = G = G = = = G ? ? C = = = = = = ? = = = = = = = = ? ? = = ? ? = = = = = = = = = = ? ? = = C T A C A A G = A A T = C C = = = A = = C G I ? = C = A = = = A ? ? T = = = = = = ? 0 P012 = = = = = G = A A = C = = T = = = = = = = = = = D A = = T G G A = C A = = T A I ? A D C T = = = T = = = G G I G = C C = ? ? ? C G = G ? = = = = = = = T = C G = A = = C = = = = = = = = = = I G = = C T A C = A G = = A T D ? C I T C = = = C = = = C C D A = T A = ? ? ? G T = T ? = = 0 P013 = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = T = = = G G I G T C ? ? ? ? C = (T) = (T) = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = C = = = C C D A C T ? ? ? ? T = (G) = (G) = = = 0 P014 ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = 0 P015 = = = G ? = G ? = A ? G ? ? = ? = = = ? ? = ? ? ? = ? ? T ? = ? ? ? ? = ? ? A = T ? D ? ? = = = T = = = G G I ? ? ? ? ? ? ? ? ? G = G = = = = = = A ? = A ? = G ? C ? ? = ? = = = ? ? = ? ? ? = ? ? C ? = ? ? ? ? = ? ? T = C ? I ? ? = = = C = = = C C D ? ? ? ? ? ? ? ? ? T = T = = = 0 P016 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = ? = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = ? = G = = = = = = 0 P017 C = T = A = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = ? = = = = C ? ? = = = I = = = = = = = C = A D T = = = = = = = = = T ? = = C = = = ? T = A = G = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = ? = = = = A ? ? = = = D = = = = = = = A = G I C = = = = = = = = = C ? = = T = = = ? 0 P018 = G = A ? = A = = G A C ? ? C = = = = T A A = T = = ? = = = = = ? ? ? ? ? ? = = ? ? = = = A C C ? = = = = C = ? ? ? A = A = T = = = = = ? ? = A = G ? = G = = A C G ? ? T = = = = C G G = C = = ? = = = = = ? ? ? ? ? ? = = ? ? = = = G T A ? = = = = G = ? ? ? C = G = C = = = = = ? ? 0 P019 ? = T = ? T G C G = = = A C ? ? ? ? ? ? ? = ? ? ? ? ? ? = ? = ? ? ? ? ? ? ? = D = = = = = = = ? ? = = = = = = = ? ? ? ? ? = ? ? = = = = = = ? = A = ? G A A A = = = G T ? ? ? ? ? ? ? = ? ? ? ? ? ? = ? = ? ? ? ? ? ? ? = I = = = = = = = ? ? = = = = = = = ? ? ? ? ? = ? ? = = = = = = 0 P020 ? = = = ? G = A ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? = = = ? ? ? ? = = ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? A ? ? ? D ? ? = = = ? ? = = G G I ? ? ? ? ? ? = ? ? ? = ? ? = = ? = = = ? T = C ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? = = = ? ? ? ? = = ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? T ? ? ? I ? ? = = = ? ? = = C C D ? ? ? ? ? ? = ? ? ? = ? ? = = 0 P021 = = = G ? = G = ? ? C G ? ? = ? ? ? ? C = = = = D = A C T G G A T C A = G T A = T A D ? ? ? = = ? = = = G G I G ? ? C ? G ? ? C G = G C = = = = = A ? = A = ? ? A C ? ? = ? ? ? ? T = = = = I = G G C T A C A A G = A A T = C C I ? ? ? = = ? = = = C C D A ? ? A ? A ? ? G T = T T = = 0 P022 = = = G A = G = ? ? ? G ? ? = C = ? ? C = = = = ? ? A C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = = (G) = = = = (C) = (G) = (C) (C) (G) = (G) ? = = = = = A G = A = ? ? ? C ? ? = G = ? ? T = = = = ? ? G G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = = (C) = = = = (A) = (A) = (T) (G) (T) = (T) ? = = 0 P023 = = = (G) = = = = ? ? ? = = = = = = = = T ? A = T ? = G = = = = = A A = T A = = = = = = = = A C C C = = = = C = A C T A = A = T = = = = = G = = = = (A) = = = = ? ? ? = = = = = = = = C ? G = C ? = A = = = = = T C = C G = = = = = = = = G T A T = = = = G = G T C C = G = C = = = = = A = 0 P024 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = ? = = = = = = = = = C C = G = C C G = G C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = ? = = = = = = = = = T A = A = T G T = T T = = 0 P025 = = ? ? = = = ? = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = T = = = = ? ? = = = ? = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = C = = 0 P026 = = = G A = ? ? = A C G ? ? = C = = = C = = = = D = A C T G G A ? C A = ? ? ? ? ? A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = C C = = = = = ? = = = A G = ? ? = G A C ? ? = G = = = T = = = = I = G G C T A C ? A G = ? ? ? ? ? C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = T G = = = = = ? 0 P027 = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = T = = = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = C = = 0 P028 = = = = ? G = A A = C = = T ? = = = = = = = = = D A = = T G G A = C A ? = ? A I ? A D C T ? ? = ? = = = ? G I ? = = = = ? ? ? ? = (C) = ? (G) (C) = = = = ? T = C G = A = = C ? = = = = = = = = = I G = = C T A C = A G ? = ? T D ? C I T C ? ? = ? = = = ? C D ? = = = = ? ? ? ? = (T) = ? (A) (T) 0 P029 ? G = A ? = A = = A C G ? ? = ? ? ? ? ? = = ? = ? ? ? C = ? ? ? ? ? ? ? G = = D = ? = = ? ? ? A ? = = = = C D A = ? = A ? ? T ? ? ? ? ? ? ? ? A = G ? = G = = G A C ? ? = ? ? ? ? ? = = ? = ? ? ? G = ? ? ? ? ? ? ? A = = I = ? = = ? ? ? C ? = = = = G I G = ? = G ? ? C ? ? ? ? ? ? ? 0 P030 = = = = = ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = C C = G ? C C G = G = = = = = = = = ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = T A = A ? T G T = T = = = 0 P031 = G = = A ? = ? G = A = A C ? C = = = = ? A ? ? = G = C = = = = = A = ? = = = D = = = = = A C C C = = = = C = A C T A = A ? T G = = = = = = = A = = G ? = ? A = C = G T ? G = = = = ? G ? ? = A = G = = = = = C = ? = = = I = = = = = G T A T = = = = G = G T C C = G ? C C = = = = = = 0 P032 = G = = = = A = = G A C = = ? G = = = T = = = = I = G G C ? A C A A G = A A T = ? C I T C = = = C = = = C C D A C T A = A = T = ? ? ? ? G = = A = = = = G = = A C G = = ? C = = = C = = = = D = A C T ? G A T C A = G T A = ? A D C T = = = T = = = G G I G T C C = G = C = ? ? ? ? A = 0 P033 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = T G G A T C A = G T A = ? A D C T = = = T = = = G G I G = C C = ? = = C ? ? G ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = C T A C A A G = A A T = ? C I T C = = = C = = = C C D A = T A = ? = = G ? ? T ? ? ? 0 P034 = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? G = ? ? G = G = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? A = ? ? T = T = = = 0 P035 = ? = G ? = ? ? = A C G = = = C = = = C = = = = ? ? A C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T ? ? ? G G I G = C C = ? = C C G = G ? = = = ? = A ? = ? ? = G A C = = = G = = = T = = = = ? ? G G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C ? ? ? C C D A = T A = ? = T G T = T ? = = 0 P036 = = = G A = G = = A C G = = = C = = = C = = = = D = A C T G G A T C A = G T A = ? A D C T = = = T = ? ? ? ? I ? = C C = ? ? C C G = G C = = = = = A G = A = = G A C = = = G = = = T = = = = I = G G C T A C A A G = A A T = ? C I T C = = = C = ? ? ? ? D ? = T A = ? ? T G T = T T = = 0 P037 ? = = = ? = ? ? = = = = ? = = ? ? ? ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? ? = ? = = = = = = ? = ? = = ? = ? ? G = G C = = ? = = = ? = ? ? = = = = ? = = ? ? ? ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? ? = ? = = = = = = ? = ? = = ? = ? ? T = T T = = 0 P038 ? A T = = = G = = = C = ? ? C C C G G = A A ? ? ? ? = C = ? ? ? ? ? ? ? = = = I = = = = = G T A = G I C = = I = ? ? A G ? ? = G T = = = A = ? G A = = = A = = = A = ? ? T G T C C = G G ? ? ? ? = G = ? ? ? ? ? ? ? = = = D = = = = = A C C = A D T = = D = ? ? C A ? ? = C G = = = G = 0 P039 = = = G A = ? ? = A C G = = = C = = = C = = = = D = A C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I ? = C C = G = C C G = G ? = = = = = A G = ? ? = G A C = = = G = = = T = = = = I = G G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D ? = T A = A = T G T = T ? = = 0 P040 = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = A T = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = G C 0 P041 = = = = A = G = = = C = A = C C C G G = A A T T = = = C T G G A = C A = = T A = T A D C T = = = = G I C G = I = T ? C G G = ? = G = = ? G = = = = = G = A = = = A = G = T G T C C = G G G C = = = G C T A C = A G = = A T = C C I T C = = = = A D T C = D = C ? A A A = ? = T = = ? A = 0 P042 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = ? ? ? = (D) (C) (T) = = = = = = = = = I G = T = G = = ? = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = ? ? ? = (I) (T) (C) = = = = = = = = = D A = C = A = = ? = = = ? = = ? 0 P043 ? = = = ? = = = ? ? ? = = ? ? ? ? ? ? = = = ? ? ? ? ? = = ? = ? ? ? ? ? ? ? = = = ? ? = ? = = = ? = ? = = = = = ? ? ? ? = = ? ? = = = = = = ? = = = ? = = = ? ? ? = = ? ? ? ? ? ? = = = ? ? ? ? ? = = ? = ? ? ? ? ? ? ? = = = ? ? = ? = = = ? = ? = = = = = ? ? ? ? = = ? ? = = = = = = 0 P044 = = = = A = G = = A C G = = = C = = = C = = = = D = A C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I ? = C C = G = C C = = = = = = = = = = G = A = = G A C = = = G = = = T = = = = I = G G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D ? = T A = A = T G = = = = = = 0 P045 ? ? = G A = G = = A C G = = = ? ? ? ? C = = = = D = A C T G G A T C A = G ? A = T ? D ? ? ? ? = ? = = = G G = ? ? ? C ? ? = ? ? = = = T = = ? ? = A G = A = = G A C = = = ? ? ? ? T = = = = I = G G C T A C A A G = A ? T = C ? I ? ? ? ? = ? = = = C C = ? ? ? A ? ? = ? ? = = = C = = 0 P046 = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = 0 P047 = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = C = = ? = = = = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = G = = ? = = = 0 P048 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = 0 P049 = = = G A = G = = A C G = = = C = = = C = = = = D = A C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I G = C C ? G = C C G = ? ? = = = = = A G = A = = G A C = = = G = = = T = = = = I = G G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D A = T A ? A = T G T = ? ? = = 0 P050 = = = G A = G = = A C G = = = C = = = C = = = = D = A C T ? G A ? ? ? ? G T A = T A D C T = = = T = = = G G I G = C ? ? G = ? ? G = G = = ? = = = A G = A = = G A C = = = G = = = T = = = = I = G G C ? A C ? ? ? ? A A T = C C I T C = = = C = = = C C D A = T ? ? A = ? ? T = T = = ? 0 P051 C = T = A = G = = = C = A = C C = = = = = = = = ? ? = = T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = C C G = G ? = ? T = A = G = A = = = A = G = T G = = = = = = = = ? ? = = C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = T G T = T ? = ? 0 P052 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = ? ? = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? ? ? ? ? ? = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = ? ? = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? ? ? ? ? ? = = ? ? = = 0 P053 = = = G A = G = = A C G = = = ? ? ? ? C = = = = D = A C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I G = C ? ? ? ? ? ? = = G ? A = = = = A G = A = = G A C = = = ? ? ? ? T = = = = I = G G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D A = T ? ? ? ? ? ? = = T ? G = 0 P054 ? = = = ? = G = = ? ? G = = ? C = = = = A A ? ? D = = C T G G A = = ? T = T A = T A D C T ? C C = = = = G = I = C ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = ? = = = ? = A = = ? ? C = = ? G = = = = G G ? ? I = = G C T A C = = ? C = A T = C C I T C ? T A = = = = C = D = T ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = 0 P055 = = = = A = G = = A C G = = = C = = = C ? = = = D = A C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = A = = G A C = = = G = = = T ? = = = I = G G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P056 ? = T = A T G C G = = = ? ? C C C G G = A A T ? = ? ? C = = = = = = = = = = = (D) = = = = = A = C C = = = = C = A = = = = = = = = = = = = = = ? = A = G G A A A = = = ? ? T G T C C = G G G ? = ? ? G = = = = = = = = = = = (I) = = = = = G = A T = = = = G = G = = = = = = = = = = = = = = 0 P057 C A T = = = G = = = C = = = = = C G G = = = T = = = = = = = = = = C = C = = ? ? ? = = = = G T A = G I C = = = = = T A = = = T G = = G ? = = T G A = = = A = = = A = = = = = T C C = = = G = = = = = = = = = = A = T = = ? ? ? = = = = A C C = A D T = = = = = C C = = = C C = = T ? = = 0 P058 ? = = = ? = = = = = = = ? ? = ? = = = = = = ? ? ? ? ? = ? ? ? ? T = ? T ? ? A = T A D C T = = = T = = = G G I G ? ? ? ? ? = = ? = = = T = ? ? = = = ? = = = = = = = ? ? = ? = = = = = = ? ? ? ? ? = ? ? ? ? A = ? C ? ? T = C C I T C = = = C = = = C C D A ? ? ? ? ? = = ? = = = C = ? 0 P059 ? = T A = = = = ? ? ? C ? ? C ? ? G G T A A ? ? ? ? G = = = = ? A = = = ? ? = = = = = = = = = = ? G I C = C = A = T ? ? = = ? ? = ? = ? ? ? ? = A G = = = = ? ? ? G ? ? T ? ? C C C G G ? ? ? ? A = = = = ? T = = = ? ? = = = = = = = = = = ? A D T = G = G = C ? ? = = ? ? = ? = ? ? ? 0 P060 = = = = A = G = = A C G = = = C = = = C = = = = D = A C T ? G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = C C G T G ? A T = = = = G = A = = G A C = = = G = = = T = = = = I = G G C ? A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = T G T C T ? G C 0 P061 ? ? = = = = = = ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? = A A ? ? ? ? = C ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = ? = = ? ? ? = ? = = = = = = = ? ? ? ? A C ? ? T = T = G ? ? ? = = = = = = ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? = G G ? ? ? ? = G ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = ? = = ? ? ? = ? = = = = = = = ? ? ? ? G T ? ? G = G = A ? 0 P062 = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = 0 P063 ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = T A A ? ? = = G = = = = = A A ? ? ? ? = = = = = = = A C C C = = = = C = A C ? A = ? = ? ? = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = C G G ? ? = = A = = = = = T C ? ? ? ? = = = = = = = G T A T = = = = G = G T ? C = ? = ? ? = = = = = = 0 P064 = = = G A = G = = A C G = = = C = = = C = = = = D = A C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I G T C ? ? G = C = = = = = = = = = = A G = A = = G A C = = = G = = = T = = = = I = G G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D A C T ? ? A = T = = = = = = = 0 P065 = G = = A = A ? = = = = = = = = T C C = = = G = = = = C = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = ? G C = A = = G = G ? = = = = = = = = C G G = = = T = = = = G = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = ? A T 0 P066 = = = G A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? G = G ? = = = = = A G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? T = T ? = = 0 P067 = = ? ? = = G = ? ? C G = = = C = = = C = = = = ? ? A C T G G A T C A = G T A = ? A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = = C = = = ? = = = = ? ? = = A = ? ? A C = = = G = = = T = = = = ? ? G G C T A C A A G = A A T = ? C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = = G = = = ? = = 0 P068 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C C = G = ? C G = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T A = A = ? G T = T = = = 0 P069 = ? = G A = G = = A C G ? ? = ? ? ? ? C = = = = D = ? C T G G A T C A = G T A = T A D C T ? ? = T = = = G G I G = C C = G = = C G = G = = = = ? = A G = A = = G A C ? ? = ? ? ? ? T = = = = I = ? G C T A C A A G = A A T = C C I T C ? ? = C = = = C C D A = T A = A = = G T = T = = = 0 P070 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P071 = = = = = = ? ? = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = T G G A T C A = G T A = ? A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = C C G ? ? = = = = = = = = = ? ? = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = C T A C A A G = A A T = ? C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = T G T ? ? = = = 0 P072 = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C C = G = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T A = A = T = = = = = = = 0 P073 = = = G A = G = = A C G = = = C = = = = A A = T D = ? C T G G A = = A T = T A = ? A D C T A C C = = = = G ? I = C = = = = = = = G = G ? = = = = = A G = A = = G A C = = = G = = = = G G = C I = ? G C T A C = = G C = A T = ? C I T C G T A = = = = C ? D = T = = = = = = = T = T ? = = 0 P074 = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = = = = 0 P075 = = = = (A) = = = ? = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? I = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = (G) = = = ? = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? D = = = = = = = = = = = = = = ? 0 P076 = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = 0 P077 = = = = A T G C G A = G ? ? = ? ? ? ? C = = = = = G A C = = = = T = = = G = = D ? = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = ? A T = = = = G G A A A G = C ? ? = ? ? ? ? T = = = = = A G G = = = = A = = = A = = I ? = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = ? G C 0 P078 = = = = = G = A A = C = = T = = = = = = = = = = D A = = T G G A = C A = = T A I T A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = C C G = G C = ? = = = = = T = C G = A = = C = = = = = = = = = = I G = = C T A C = A G = = A T D C C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = T G T = T T = ? 0 P079 = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = ? 0 P080 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? ? ? ? 0 P081 = = = = A = G = = A C G = = = C = = = C = = = = D = A C ? ? ? A T C A = G T ? ? ? A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = C C G T G ? A T = = = = G = A = = G A C = = = G = = = T = = = = I = G G ? ? ? C A A G = A A ? ? ? C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = T G T C T ? G C 0 P082 = = = = A = G = = A C G = = = C = = = C = = = ? D = ? C T G G A T C A = G T A = T A D C T = = = T = = = G G I G = = = = = = = = = ? = = (A) = = = = = G = A = = G A C = = = G = = = T = = = ? I = ? G C T A C A A G = A A T = C C I T C = = = C = = = C C D A = = = = = = = = = ? = = (G) = 0 P083 = = = = = G = A A = C = = T = = = = = = = = = = ? ? = = T G G A = C A = = T A I T A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = C C G = G ? = = = = = = = T = C G = A = = C = = = = = = = = = = ? ? = = C T A C = A G = = A T D C C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = T G T = T ? = = 0 P084 = = = = = G = A A = C = = T = = = = ? = = = = = D A = = T G G A = C A = = T A I T A D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = C C G = G = = = = = = = = T = C G = A = = C = = = = ? = = = = = I G = = C T A C = A G = = A T D C C I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = T G T = T = = = 0 P085 = = = = = = = ? = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = 0 P086 C = T A = = = = = G = C A = C = = = = T = = = = = A G G = = = = = = = = = = = = ? = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = A G = = = = = A = G G = T = = = = C = = = = = G A C = = = = = = = = = = = = ? = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = 0 P087 C = T A = = = = = G = C A = C = C G G T A A T T = = G = = ? ? = ? ? ? ? = = = I ? = = = = G T A = G I C = = = = T = = = G = = G T = ? = A = T = A G = = = = = A = G G = T = T C C C G G G C = = A = = ? ? = ? ? ? ? = = = D ? = = = = A C C = A D T = = = = C = = = A = = C G = ? = G = 0 P088 C = T A = = = = = G = C A = C = C G G T A A T T = = G G = = = = A A = T A = = = = = = = = A C C C = = = = C = A C T A = A = T G = = ? = = = T = A G = = = = = A = G G = T = T C C C G G G C = = A C = = = = T C = C G = = = = = = = = G T A T = = = = G = G T C C = G = C C = = ? = = = 0 P089 = = = (G) = = ? ? = A = G ? ? ? = T C C C G = G = = = ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? = G I C = = = A = ? = A = = = ? = T = ? A T = = = (A) = = ? ? = G = C ? ? ? = C G G T A = T = = = ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? = A D T = = = G = ? = G = = = ? = C = ? G C 0 P090 = ? = G A = ? = = A C G = = = C = = = C = = = = D = ? C T G G A T C A = G T A = ? ? D C T = = = T = = = G G I G = C C = G = ? C ? = G = = = = ? = A G = ? = = G A C = = = G = = = T = = = = I = ? G C T A C A A G = A A T = ? ? I T C = = = C = = = C C D A = T A = A = ? G ? = T = = = END BESTPAIRS2 Phase probabilities at each site with phase known positions indicated by = and missing data positions indicated by ? BEGIN PHASEPROBS = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = ? ? ? ? ? ? ? = = = = ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 ? ? 1.00 ? ? = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = ? 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = ? = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = ? = = = 1.00 1.00 = = 1.00 ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = ? 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 = 1.00 ? ? = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = ? ? = ? ? ? ? = ? = = = = = = = = ? ? = = = = = ? ? = = = ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = ? = = 1.00 = ? = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 ? = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = ? = = ? = = = ? = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 ? = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 0.98 0.98 = 0.98 = ? ? 0.93 = ? 0.91 = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = ? ? = = 1.00 = 1.00 = ? 1.00 = = = = ? = = = 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 ? ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = ? ? ? ? ? ? = = = = 1.00 ? 1.00 ? 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 ? 1.00 = = = 1.00 = ? = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? ? ? = 0.98 ? = = = = = = = = ? ? = = ? ? = = = = = = = = = = ? ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 ? ? 1.00 = = = = = = ? = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? ? 1.00 1.00 = 1.00 ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? 1.00 = 0.75 = 0.75 = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = 1.00 ? = 1.00 ? = 1.00 ? 1.00 ? ? = ? = = = ? ? = ? ? ? = ? ? 1.00 ? = ? ? ? ? = ? ? 1.00 = 1.00 ? 1.00 ? ? = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = ? = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = ? = = = = 1.00 ? ? = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 ? = = 1.00 = = = ? = 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 ? ? 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = ? = = = = = ? ? ? ? ? ? = = ? ? = = = 1.00 1.00 1.00 ? = = = = 1.00 = ? ? ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = ? ? ? = 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 ? ? ? ? ? ? ? = ? ? ? ? ? ? = ? = ? ? ? ? ? ? ? = 1.00 = = = = = = = ? ? = = = = = = = ? ? ? ? ? = ? ? = = = = = = ? = = = ? 1.00 = 1.00 ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? = = = ? ? ? ? = = ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.00 ? ? ? 1.00 ? ? = = = ? ? = = 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? ? ? = ? ? ? = ? ? = = = = = 1.00 ? = 1.00 = ? ? 1.00 1.00 ? ? = ? ? ? ? 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? ? ? = = ? = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? 0.98 ? 0.98 ? ? 0.94 0.93 = 0.93 0.91 = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = ? ? ? 1.00 ? ? = 1.00 = ? ? 1.00 = = = = ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 0.55 = = = = 0.53 = 0.53 = 0.53 0.53 0.53 = 0.53 ? = = = = = 0.86 = = = = ? ? ? = = = = = = = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 0.92 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = ? = = = = = = = = = 0.98 0.98 = 0.98 = 0.98 1.00 1.00 = 1.00 0.98 = = = = ? ? = = = ? = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = ? ? = 1.00 1.00 1.00 ? ? = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 = ? ? ? ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 0.99 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 0.99 = = = = = ? = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = 1.00 = = = = = = ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 ? = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 ? = ? 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? = ? = = = ? 1.00 1.00 ? = = = = ? ? ? ? = 0.72 = ? 0.72 0.72 ? 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 ? ? = ? ? ? ? ? = = ? = ? ? ? 1.00 = ? ? ? ? ? ? ? 1.00 = = 1.00 = ? = = ? ? ? 1.00 ? = = = = 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 ? ? 1.00 ? ? ? ? ? ? ? = = = = = ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 ? = ? 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 ? 1.00 = = = = ? 1.00 ? ? = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = ? = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = ? 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = ? ? ? ? 0.98 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? = = 1.00 ? ? 1.00 ? ? ? = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? 1.00 = ? ? 1.00 = 1.00 = = = = ? = 1.00 ? = ? ? = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 ? ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = 0.99 0.99 = ? = 0.99 0.98 0.98 = 0.98 ? = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = ? ? ? ? 1.00 ? = 0.97 0.97 = ? ? 0.97 0.96 0.94 = 0.94 0.92 = = ? = = = ? = ? ? = = = = ? = = ? ? ? ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? ? = ? = = = = = = ? = ? = = ? = ? ? 1.00 = 1.00 1.00 = = ? 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 ? ? ? ? = 1.00 = ? ? ? ? ? ? ? = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = ? ? 1.00 1.00 ? ? = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = ? ? = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 ? = 0.99 0.99 = 0.99 = 0.99 0.99 0.99 = 0.99 ? = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 = = ? 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = ? ? ? = 0.76 0.76 0.76 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = ? = = = ? = = ? ? = = = ? = = = ? ? ? = = ? ? ? ? ? ? = = = ? ? ? ? ? = = ? = ? ? ? ? ? ? ? = = = ? ? = ? = = = ? = ? = = = = = ? ? ? ? = = ? ? = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 = 1.00 = 0.99 1.00 = = = = = = ? ? = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = ? ? ? ? 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? 1.00 = 1.00 ? 1.00 ? ? ? ? = ? = = = 1.00 1.00 = ? ? ? 1.00 ? ? = ? ? = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = 1.00 = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 0.99 0.99 ? 0.99 = 0.99 0.98 0.98 = ? ? = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 ? ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 = ? ? 1.00 = 1.00 = = ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = ? ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 0.94 0.99 = 0.99 ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = ? ? = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? ? ? ? ? ? = = ? ? = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = ? ? ? ? 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? ? ? ? ? = = 1.00 ? 1.00 = ? = = = ? = 1.00 = = ? ? 1.00 = = ? 1.00 = = = = 1.00 1.00 ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 ? = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? = ? ? 1.00 = = = = = = = = = = = 0.69 = = = = = 0.97 = 0.97 0.97 = = = = 0.97 = 0.97 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = ? ? ? = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 ? = = ? = = = ? = = = = = = = ? ? = ? = = = = = = ? ? ? ? ? = ? ? ? ? 1.00 = ? 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? ? = = ? = = = 1.00 = ? ? = 1.00 1.00 = = = = ? ? ? 1.00 ? ? 1.00 ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? 1.00 = = = = ? 1.00 = = = ? ? = = = = = = = = = = ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 ? ? = = ? ? = ? = ? ? ? = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 ? ? = = = = = = ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? = 1.00 1.00 ? ? ? ? = 1.00 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = ? = = ? ? ? = ? = = = = = = = ? ? ? ? 1.00 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 = 1.00 ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = 1.00 1.00 1.00 ? ? = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 ? ? ? ? = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 ? 1.00 = ? = ? ? = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 ? = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = ? 1.00 1.00 = = = 0.93 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? 1.00 = 1.00 ? = = = = ? ? = = 1.00 = ? ? 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = ? 1.00 1.00 = 1.00 = = = = ? = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 ? ? = ? ? ? ? 1.00 = = = = 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = 0.98 0.99 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = = = = = = = 0.99 = 0.99 ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = = = = = = = = 0.59 = = = ? = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? 1.00 = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? = ? ? ? ? 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 ? = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = ? 0.98 0.98 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 0.99 = ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 ? ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 ? ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = ? 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = ? = = 0.86 = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = ? ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = ? = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = ? = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = ? = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.95 = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = ? ? = ? ? ? ? = = = 1.00 ? = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = ? = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = ? = = = = = = 0.68 = = ? ? = 1.00 = 1.00 ? ? ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = ? = 1.00 = = = ? = 1.00 = ? 1.00 1.00 = ? = 1.00 1.00 = ? = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = ? ? 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = ? 1.00 ? = 1.00 = = = END PHASEPROBS