Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000370 C 0.02 T 0.98 0.04 000486 T 0.02 C 0.98 0.04 001049 T 0.06 C 0.94 0.11 001465 - 0.04 + 0.96 0.08 001937 - 0.01 + 0.99 0.01 002392 A 0.01 G 0.99 0.01 002728 T 0.01 C 0.99 0.01 003506 A 0.01 G 0.99 0.02 003648 T 0.01 C 0.99 0.02 003756 G 0.01 A 0.99 0.01 003880 A 0.06 G 0.94 0.10 003944 A 0.01 G 0.99 0.03 004361 G 0.01 A 0.99 0.01 004377 G 0.01 T 0.99 0.01 004519 G 0.01 A 0.99 0.01 004863 A 0.07 T 0.93 0.14 004915 A 0.26 G 0.74 0.38 005043 A 0.01 G 0.99 0.01 006123 T 0.01 C 0.99 0.03 006126 G 0.01 A 0.99 0.01 006312 G 0.48 A 0.52 0.50 007386 A 0.01 C 0.99 0.01 007792 G 0.01 C 0.99 0.02 007848 C 0.01 A 0.99 0.02 008026 G 0.01 A 0.99 0.01 008083 T 0.07 G 0.93 0.13 008253 G 0.01 A 0.99 0.01 008642 A 0.01 T 0.99 0.01 008720 C 0.02 T 0.98 0.03 008995 A 0.40 G 0.60 0.48 009003 C 0.08 A 0.92 0.15 009479 G 0.01 C 0.99 0.01 009868 C 0.04 T 0.96 0.07 010020 G 0.08 A 0.92 0.15 010051 G 0.34 A 0.66 0.45 010300 C 0.48 A 0.52 0.50 010765 G 0.04 A 0.96 0.07 010831 C 0.34 G 0.66 0.45 011044 C 0.01 T 0.99 0.01 011070 G 0.02 A 0.98 0.04 011103 A 0.01 G 0.99 0.01 012141 C 0.01 T 0.99 0.03 012862 G 0.11 A 0.89 0.20 012960 C 0.08 T 0.92 0.15 013170 T 0.11 C 0.89 0.19 014338 G 0.01 A 0.99 0.01 016880 G 0.01 C 0.99 0.01 016916 G 0.48 C 0.52 0.50 016970 T 0.05 C 0.95 0.10 017194 G 0.01 A 0.99 0.03 017248 C 0.06 G 0.94 0.12 017318 T 0.01 A 0.99 0.01 017397 G 0.01 T 0.99 0.01 017478 A 0.01 G 0.99 0.03 017495 C 0.06 G 0.94 0.12 017736 T 0.33 C 0.67 0.44 017873 A 0.04 G 0.96 0.08 017959 G 0.12 A 0.88 0.21 017991 G 0.03 A 0.97 0.05 018569 G 0.12 A 0.88 0.22 018649 C 0.01 T 0.99 0.01 018858 T 0.01 G 0.99 0.03 019075 G 0.03 A 0.97 0.05 019128 G 0.06 T 0.94 0.11 019194 C 0.10 T 0.90 0.19 019401 G 0.01 A 0.99 0.01 019608 + 0.01 - 0.99 0.01 020010 - 0.43 + 0.57 0.49 020060 G 0.09 A 0.91 0.16 022258 G 0.32 A 0.68 0.44 022592 G 0.01 A 0.99 0.01 022618 G 0.01 A 0.99 0.02 022675 T 0.01 A 0.99 0.02 022701 G 0.42 C 0.58 0.49 023815 A 0.01 G 0.99 0.01 023988 T 0.44 C 0.56 0.49 024232 G 0.44 T 0.56 0.49 024414 G 0.45 A 0.55 0.50 024635 + 0.01 - 0.99 0.02 024658 C 0.01 T 0.99 0.01 024731 A 0.44 C 0.56 0.49 024801 A 0.35 T 0.65 0.46 024811 A 0.47 C 0.53 0.50 024939 A 0.47 G 0.53 0.50 024951 T 0.01 C 0.99 0.01 025074 C 0.06 T 0.94 0.11 025477 G 0.01 A 0.99 0.03 025480 A 0.36 G 0.64 0.46 025572 T 0.42 A 0.58 0.49 025833 A 0.43 T 0.57 0.49 025857 C 0.01 T 0.99 0.01 025897 - 0.09 + 0.91 0.16 026393 G 0.01 A 0.99 0.03 026630 T 0.43 C 0.57 0.49 027911 G 0.04 T 0.96 0.08 027931 A 0.43 C 0.57 0.49 028150 A 0.01 G 0.99 0.01 028239 A 0.01 G 0.99 0.02 029045 A 0.03 G 0.97 0.05 029301 T 0.04 C 0.96 0.08 029369 T 0.01 A 0.99 0.01 029480 A 0.01 C 0.99 0.02 029537 G 0.01 C 0.99 0.02 029595 - 0.42 + 0.58 0.49 029663 C 0.01 A 0.99 0.01 029686 C 0.42 T 0.58 0.49 030761 T 0.02 C 0.98 0.04 030796 T 0.43 C 0.57 0.49 031034 G 0.04 A 0.96 0.08 031148 G 0.01 T 0.99 0.02 031225 T 0.01 A 0.99 0.02 031310 A 0.01 C 0.99 0.01 031571 A 0.01 G 0.99 0.03 031576 A 0.02 C 0.98 0.04 031595 G 0.03 A 0.97 0.06 031751 G 0.03 A 0.97 0.06 031801 C 0.01 G 0.99 0.02 032283 G 0.11 A 0.89 0.19 032448 G 0.01 C 0.99 0.01 032467 T 0.01 C 0.99 0.01 032575 T 0.06 C 0.94 0.12 034478 - 0.03 + 0.97 0.06 034646 G 0.01 T 0.99 0.03 034655 T 0.01 C 0.99 0.01 034821 C 0.01 T 0.99 0.02 034835 C 0.02 T 0.98 0.03 035113 A 0.09 C 0.91 0.16 035210 T 0.03 G 0.97 0.05 035269 T 0.01 C 0.99 0.01 035611 C 0.01 T 0.99 0.01 036106 C 0.02 G 0.98 0.04 036272 G 0.01 T 0.99 0.01 036549 C 0.40 T 0.60 0.48 036906 A 0.01 G 0.99 0.01 037227 A 0.06 G 0.94 0.12 037243 - 0.06 + 0.94 0.12 037269 T 0.06 C 0.94 0.11 037405 A 0.01 T 0.99 0.02 038952 G 0.41 C 0.59 0.48 038960 T 0.01 C 0.99 0.01 039091 G 0.05 A 0.95 0.09 039319 C 0.43 G 0.57 0.49 039494 + 0.44 - 0.56 0.49 039933 T 0.01 C 0.99 0.01 039986 A 0.42 G 0.58 0.49 040020 G 0.01 A 0.99 0.01 040091 G 0.03 A 0.97 0.06 040211 + 0.02 - 0.98 0.04 040384 T 0.03 C 0.97 0.05 040408 A 0.01 G 0.99 0.01 040455 C 0.04 T 0.96 0.07 040705 C 0.04 T 0.96 0.07 040791 A 0.01 C 0.99 0.02 040904 C 0.01 G 0.99 0.03 040920 T 0.01 C 0.99 0.01 041116 T 0.02 C 0.98 0.03 041117 A 0.02 G 0.98 0.05 041122 T 0.02 C 0.98 0.05 042036 C 0.01 T 0.99 0.01 042069 C 0.04 A 0.96 0.07 042790 C 0.01 T 0.99 0.02 043012 T 0.01 G 0.99 0.01 043361 G 0.01 A 0.99 0.02 043491 A 0.02 T 0.98 0.03 043939 T 0.07 C 0.93 0.13 043999 C 0.46 T 0.54 0.50 045094 C 0.40 A 0.60 0.48 045139 T 0.02 C 0.98 0.04 045187 G 0.08 A 0.92 0.15 047731 T 0.01 C 0.99 0.01 047917 G 0.01 A 0.99 0.01 047940 G 0.44 A 0.56 0.49 048176 A 0.03 G 0.97 0.06 048185 A 0.01 G 0.99 0.02 048206 C 0.06 T 0.94 0.12 048553 G 0.03 A 0.97 0.05 048913 - 0.01 + 0.99 0.02 049903 T 0.47 C 0.53 0.50 049932 T 0.01 G 0.99 0.01 050196 C 0.01 T 0.99 0.01 050627 C 0.41 G 0.59 0.48 051781 A 0.01 C 0.99 0.01 051860 G 0.01 T 0.99 0.03 052204 C 0.01 G 0.99 0.01 052295 T 0.01 C 0.99 0.01 052296 G 0.45 T 0.55 0.50 052351 T 0.01 A 0.99 0.01 052445 A 0.02 T 0.98 0.05 052567 C 0.06 T 0.94 0.12 053002 G 0.43 T 0.57 0.49 053136 T 0.01 C 0.99 0.01 053147 T 0.01 C 0.99 0.01 053383 A 0.04 G 0.96 0.08 053629 G 0.01 A 0.99 0.02 053816 G 0.01 A 0.99 0.03 054069 C 0.01 G 0.99 0.03 054209 G 0.02 A 0.98 0.05 054332 C 0.17 T 0.83 0.29 054383 T 0.01 G 0.99 0.02 054409 T 0.03 C 0.97 0.07 054424 G 0.14 A 0.86 0.25 054553 C 0.07 T 0.93 0.12 055184 A 0.01 G 0.99 0.01 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001465: CCAGGGTTCTCTCCTCA 001937: A 019608: A 020010: CAG 024635: A 025897: TT 029595: A 034478: A 037243: AG 039494: t 040211: TA 048913: CTTTT